30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3313 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  594  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  49.66 
 
 		 596 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  42.94 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  43.75 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  43.95 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  42.86 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  40 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  44.59 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  35.38 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  39.19 
 
 		 507 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  38.96 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  39.07 
 
 		 151 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  43.44 
 
 		 273 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  43.44 
 
 		 273 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  33.53 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  42.62 
 
 		 233 aa  95.9  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  43.22 
 
 		 127 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  41.03 
 
 		 234 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  37.6 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  32.89 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  42.19 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6577  hypothetical protein  28.03 
 
 		 585 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2319  hypothetical protein  26.49 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2164  hypothetical protein  26.49 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.107733 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  40.24 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  29.31 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  30.14 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  31.58 
 
 		 481 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  28.97 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>