28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6597 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  100 
 
 		 127 aa  266  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  51.69 
 
 		 287 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  52.68 
 
 		 301 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  46.55 
 
 		 277 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  45.05 
 
 		 291 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  43.7 
 
 		 268 aa  103  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  49.14 
 
 		 596 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  43.22 
 
 		 273 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  43.22 
 
 		 273 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  47.97 
 
 		 299 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  44.17 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  46.43 
 
 		 313 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  46.15 
 
 		 268 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  43.22 
 
 		 291 aa  94.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  45.22 
 
 		 507 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  37.76 
 
 		 302 aa  90.1  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  39.47 
 
 		 271 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  39.83 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  43.96 
 
 		 234 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  36.47 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  35.71 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  42.19 
 
 		 280 aa  50.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  30.93 
 
 		 283 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  33.82 
 
 		 306 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  34.83 
 
 		 303 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 500 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  57.58 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  29.63 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>