30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0138 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  613  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  50.68 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  57.24 
 
 		 596 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  49.4 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  51.39 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  47.68 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  48.97 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  44.97 
 
 		 507 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  42.86 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  48.03 
 
 		 151 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  44.9 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  41.38 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  41.38 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  43.92 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  35.58 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  47.97 
 
 		 127 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  43.65 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  39.31 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  41.22 
 
 		 234 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  34.31 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  34.15 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  47.95 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5028  hypothetical protein  23.23 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  37.31 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  37.8 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  27.18 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  34.67 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 500 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  32.94 
 
 		 481 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>