23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0816 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  51.32 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  37.12 
 
 		 301 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  34.31 
 
 		 299 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  41.67 
 
 		 596 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  35.51 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  32.62 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  32.62 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  37.6 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  33.1 
 
 		 151 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  29.15 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  32.23 
 
 		 507 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  35.83 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  30.15 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  33.05 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  28.77 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  27.01 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  35.71 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  30.32 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  31.01 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  30.58 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  29.41 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>