24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1614 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  77.63 
 
 		 233 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  41.6 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  34.8 
 
 		 302 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  40.41 
 
 		 313 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  40 
 
 		 151 aa  98.6  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  44.26 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  45.83 
 
 		 507 aa  96.3  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  43.44 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  40.52 
 
 		 301 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  41.22 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  40.48 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  40.48 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  40.71 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  40.16 
 
 		 596 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  41.03 
 
 		 291 aa  85.5  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  36.72 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  38.19 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  40 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  45.16 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  30.83 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2164  hypothetical protein  28.37 
 
 		 291 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.107733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2319  hypothetical protein  28.37 
 
 		 291 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  28.93 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>