31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0715 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  100 
 
 		 287 aa  594  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  39.35 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  52.6 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  52.5 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  54.73 
 
 		 151 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  51.52 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  54.84 
 
 		 596 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  49.7 
 
 		 313 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  49.4 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  42.94 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  40.59 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  40.59 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  48.41 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  42.59 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  46.48 
 
 		 507 aa  126  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  47.18 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  51.69 
 
 		 127 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  42.95 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  44.26 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  35.51 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  59.02 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1435  hypothetical protein  31.25 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  32.76 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  31.07 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  30.86 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 500 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  31.08 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  29.41 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6577  hypothetical protein  24.39 
 
 		 585 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>