33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2553 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  41.79 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  55.56 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  54.49 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  52.44 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  37.4 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  48.68 
 
 		 151 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  48.41 
 
 		 287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  46.94 
 
 		 596 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  41.76 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  41.61 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  38.96 
 
 		 291 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  43.92 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  39.66 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  39.66 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  40.27 
 
 		 507 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  38.99 
 
 		 233 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  46.15 
 
 		 127 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  38.19 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  32.26 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  27.01 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  44.78 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1435  hypothetical protein  22.84 
 
 		 433 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  32.99 
 
 		 481 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  30.49 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  35.62 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  28.05 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  36.36 
 
 		 303 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  29.41 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  30.63 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2319  hypothetical protein  26.79 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2164  hypothetical protein  26.79 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.107733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>