39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1435 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1435  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  788    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  25.78 
 
 		 2313 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  51.89 
 
 		 840 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  28.87 
 
 		 1000 aa  77.4  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  33.93 
 
 		 671 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.1 
 
 		 830 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  40.12 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48647  predicted protein  39.18 
 
 		 636 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  32.26 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  29.8 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  25.33 
 
 		 916 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  37.93 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  34.78 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  37.69 
 
 		 687 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  30.26 
 
 		 625 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.57 
 
 		 1567 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  32.77 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  42.53 
 
 		 1217 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  36.51 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  52.5 
 
 		 908 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47575  predicted protein  33.17 
 
 		 744 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  38.37 
 
 		 489 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  41.84 
 
 		 1689 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.67 
 
 		 1888 aa  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  38.31 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  31.55 
 
 		 2353 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06210  Pol II transcription elongation factor, putative  36.48 
 
 		 1152 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.42 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  29.91 
 
 		 590 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  22.93 
 
 		 1461 aa  47  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  23.93 
 
 		 952 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.07 
 
 		 261 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  36.28 
 
 		 582 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1493  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.95 
 
 		 633 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  22.08 
 
 		 648 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  29.31 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  43.82 
 
 		 223 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  31.09 
 
 		 3670 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40158  predicted protein  42.37 
 
 		 643 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>