19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2866 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  64.87 
 
 		 283 aa  374  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  48.03 
 
 		 500 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  45.39 
 
 		 481 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  41.46 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  39.34 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  30.92 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4041  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  35.62 
 
 		 301 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  42.19 
 
 		 127 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  31.07 
 
 		 596 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  30.77 
 
 		 151 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  31.07 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  29.31 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  28.05 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  31.76 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  31.76 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  34.78 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>