29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4421 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  100 
 
 		 596 aa  1224    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  58.22 
 
 		 301 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  57.24 
 
 		 299 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  54.84 
 
 		 287 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  49.66 
 
 		 291 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  52.38 
 
 		 268 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  49.65 
 
 		 313 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  50.32 
 
 		 277 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  48.32 
 
 		 151 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  41.03 
 
 		 507 aa  139  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  43.45 
 
 		 291 aa  137  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  46.94 
 
 		 268 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  42.76 
 
 		 273 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  42.76 
 
 		 273 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  41.61 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  37.65 
 
 		 302 aa  108  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  41.03 
 
 		 233 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  49.14 
 
 		 127 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  40.16 
 
 		 234 aa  90.1  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  41.67 
 
 		 261 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  46.67 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  31.03 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  39.39 
 
 		 306 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  23.96 
 
 		 303 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  31.07 
 
 		 280 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  29.13 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  34.52 
 
 		 303 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1435  hypothetical protein  30.71 
 
 		 433 aa  43.9  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.224548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>