22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0444 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  978    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  44.91 
 
 		 283 aa  147  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  45.39 
 
 		 280 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  39.74 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  44.72 
 
 		 306 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  36.59 
 
 		 300 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  34.19 
 
 		 303 aa  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  32.99 
 
 		 268 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  30.88 
 
 		 313 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  33.71 
 
 		 277 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  33.33 
 
 		 151 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  29.41 
 
 		 321 aa  47.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 		 409 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  34.09 
 
 		 291 aa  47  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 1297 aa  47  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  28.74 
 
 		 301 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 		 1013 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 269 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  32.94 
 
 		 299 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.58 
 
 		 810 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  31.71 
 
 		 596 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>