159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1049 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1049  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1668  cyclic nucleotide-binding protein  88.1 
 
 		 209 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.637535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0576  cyclic nucleotide-binding  74.15 
 
 		 211 aa  320  8e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0586  cyclic nucleotide-binding protein  73.66 
 
 		 211 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0550  cyclic nucleotide-binding protein  78.12 
 
 		 211 aa  317  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2689  cyclic nucleotide-binding protein  73.06 
 
 		 208 aa  297  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.0072891  normal  0.636365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  53.8 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3601  cyclic nucleotide-binding  48 
 
 		 224 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0690816  normal  0.803864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1913  cyclic nucleotide-binding protein  48.77 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7109  cyclic nucleotide-binding protein  47.83 
 
 		 222 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2203  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  49.74 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.24757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0652  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  45.25 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0560  cyclic nucleotide-binding  47.09 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5778  cyclic nucleotide-binding protein  39.66 
 
 		 353 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.714206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4028  Thioredoxin-disulfide reductase  34.15 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0134605  normal  0.10391 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  27.66 
 
 		 367 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.46 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6433  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.9 
 
 		 561 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.25 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  29.01 
 
 		 407 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  26.47 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.63 
 
 		 858 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  30.21 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.66 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  30.63 
 
 		 124 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 597 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4440  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 		 575 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0105368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 243 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  48.9  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.577679  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 263 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  25.24 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0894  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.6 
 
 		 570 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410384  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.42 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.41 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  32.74 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1753  cyclic nucleotide-binding protein  26.19 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1853  hypothetical protein  24.64 
 
 		 100 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.89 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3161  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1858  hypothetical protein  23.19 
 
 		 100 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  28.67 
 
 		 449 aa  46.6  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4894  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.63 
 
 		 588 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  29 
 
 		 606 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  29.2 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  29 
 
 		 606 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  29.2 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2391  cyclic nucleotide-binding protein  28.91 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2472  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.82 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1179  cyclic nucleotide-binding protein  28.09 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 630 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.61 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.21 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1903  hypothetical protein  31.08 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0942609 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  29.2 
 
 		 266 aa  45.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  26.77 
 
 		 739 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  26.09 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.29 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2778  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0529131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2505  hypothetical protein  29.35 
 
 		 86 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.279612  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.64 
 
 		 507 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  28.72 
 
 		 621 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  25.6 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  32.58 
 
 		 639 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>