54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01580 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01580  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  137  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.577679  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000325  hypothetical protein  44.78 
 
 
81 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.681006  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0681  hypothetical protein  41.79 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.657209  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06129  uroporphyrinogen decarboxylase  43.28 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3882  hypothetical protein  44.12 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.75792  hitchhiker  0.00000229094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3369  hypothetical protein  43.75 
 
 
84 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926269  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2866  hypothetical protein  36.76 
 
 
207 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0637  hypothetical protein  42.62 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3892  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3722  uroporphyrinogen decarboxylase  42.19 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.168945  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0422  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0434  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431755  hitchhiker  0.00188375 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0448  hypothetical protein  43.75 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0408  hypothetical protein  40.62 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0042697  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0509  hypothetical protein  42.19 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3548  hypothetical protein  40.62 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00713836  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3191  hypothetical protein  40.98 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107288  normal  0.334756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4196  hypothetical protein  42.19 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3199  hypothetical protein  37.88 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3469  hypothetical protein  42.62 
 
 
80 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.652617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3592  hypothetical protein  42.62 
 
 
80 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0893  hypothetical protein  42.62 
 
 
80 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0772  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0531  hypothetical protein  40.62 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4093  hypothetical protein  40.62 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3393  hypothetical protein  42.62 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2505  hypothetical protein  37.7 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.279612  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3789  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0944  hypothetical protein  39.68 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.225877  normal  0.316491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0562  hypothetical protein  39.06 
 
 
80 aa  52  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3941  hypothetical protein  42.62 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.941629  normal  0.273389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2172  hypothetical protein  39.19 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.722768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2943  hypothetical protein  40.98 
 
 
79 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0464  hypothetical protein  36.36 
 
 
84 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3091  hypothetical protein  40.98 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0907  hypothetical protein  38.1 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495261  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3007  hypothetical protein  40.98 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0169292  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2460  hypothetical protein  35.38 
 
 
208 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.66442  normal  0.0198742 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3030  hypothetical protein  38.1 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0478  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1069  hypothetical protein  39.34 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1049  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
210 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085615  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1903  hypothetical protein  33.85 
 
 
207 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0942609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1668  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
209 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.637535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3138  hypothetical protein  37.31 
 
 
210 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000486476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2689  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 
208 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.0072891  normal  0.636365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3680  hypothetical protein  37.7 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0550  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0576  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0586  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1894  hypothetical protein  33.85 
 
 
207 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510303  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1509  hypothetical protein  34.62 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.524396  normal  0.651894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3130  hypothetical protein  23.81 
 
 
208 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0192  hypothetical protein  34.62 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>