111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0586 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0586  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 211 aa  433  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0576  cyclic nucleotide-binding  98.1 
 
 		 211 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0550  cyclic nucleotide-binding protein  95.26 
 
 		 211 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1049  cyclic nucleotide-binding protein  73.66 
 
 		 210 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1668  cyclic nucleotide-binding protein  76.02 
 
 		 209 aa  314  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.637535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2689  cyclic nucleotide-binding protein  69.65 
 
 		 208 aa  291  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.0072891  normal  0.636365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3601  cyclic nucleotide-binding  45.81 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0690816  normal  0.803864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1913  cyclic nucleotide-binding protein  46.81 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7109  cyclic nucleotide-binding protein  45.36 
 
 		 222 aa  184  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2203  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  45.32 
 
 		 247 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.24757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0652  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.19 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0560  cyclic nucleotide-binding  45.7 
 
 		 275 aa  174  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5778  cyclic nucleotide-binding protein  35.9 
 
 		 353 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.714206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.83 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.95 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.62 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3161  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 263 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1853  hypothetical protein  26.09 
 
 		 100 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1858  hypothetical protein  26.09 
 
 		 100 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  30.48 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.44 
 
 		 148 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.1 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4028  Thioredoxin-disulfide reductase  29.25 
 
 		 538 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0134605  normal  0.10391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 		 148 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  27.84 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  26.27 
 
 		 407 aa  48.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 243 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.93 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0285  cyclic nucleotide-binding protein  30.69 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.47 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2866  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.44 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  28.43 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  26.47 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.81 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  28.16 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  33.78 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  28.89 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.577679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27700  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  33.65 
 
 		 171 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  29.82 
 
 		 413 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.43 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  28.81 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.24 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6433  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.43 
 
 		 561 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  28.81 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.68 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.26 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4894  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.27 
 
 		 588 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.29 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1579  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  25 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  28.57 
 
 		 749 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  24.04 
 
 		 495 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  27.83 
 
 		 124 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  30.11 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.12 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  25.78 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  24.22 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  24.22 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  24.22 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  24.22 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  24.22 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.47 
 
 		 858 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  25.62 
 
 		 367 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  34.48 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 200 aa  42  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  26.09 
 
 		 211 aa  42  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>