More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1771 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 424 aa  870    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  66.27 
 
 		 425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  52.63 
 
 		 419 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  51.67 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  51.91 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  51.67 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  49.64 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  50.83 
 
 		 418 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  50.71 
 
 		 420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  50.6 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  49.53 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  47.14 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  47.16 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  47.63 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  47.63 
 
 		 421 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  46.68 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  45.61 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  46.68 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  46.68 
 
 		 416 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  47.27 
 
 		 444 aa  411  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  45.5 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  45.5 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  45.5 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  46.68 
 
 		 416 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  45.5 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  45.26 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  45.5 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  45.5 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  47.03 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.100706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  46.68 
 
 		 416 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  47.41 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  45.5 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  45.5 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  46.17 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  45.39 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  47.89 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  44.81 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  46 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  40.29 
 
 		 421 aa  346  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  38.85 
 
 		 419 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  36.79 
 
 		 427 aa  303  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  35.38 
 
 		 427 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  35.56 
 
 		 427 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  33.41 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  26.08 
 
 		 413 aa  96.7  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  23.75 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 411 aa  86.7  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  23.61 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  27.02 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  26.23 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  24.63 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  26 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.72 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  26.72 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  22.93 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  25.88 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  24.83 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  25.66 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  25.06 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  25.15 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4380  GntR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  24.74 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  24.56 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  25.06 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 395 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  26.22 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  25.43 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  25.24 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  24.4 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  25.23 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  22.42 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  24.48 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  25.07 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>