More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3988 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  92.29 
 
 		 417 aa  799    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  92.05 
 
 		 417 aa  797    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  99.52 
 
 		 416 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  77.16 
 
 		 418 aa  687    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  92.29 
 
 		 417 aa  799    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  90.12 
 
 		 416 aa  783    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  80.05 
 
 		 456 aa  711    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 416 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  92.29 
 
 		 417 aa  799    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  77.88 
 
 		 417 aa  695    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  82.65 
 
 		 440 aa  704    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.100706 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  99.52 
 
 		 416 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  78.37 
 
 		 416 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  99.76 
 
 		 416 aa  861    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  92.29 
 
 		 417 aa  799    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  92.05 
 
 		 417 aa  796    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  79.85 
 
 		 402 aa  662    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  92.29 
 
 		 417 aa  798    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  80.29 
 
 		 421 aa  709    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  77.83 
 
 		 417 aa  681    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  99.28 
 
 		 416 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  92.29 
 
 		 417 aa  799    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  92.05 
 
 		 417 aa  796    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  65.62 
 
 		 419 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  63.94 
 
 		 417 aa  578  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  64.82 
 
 		 415 aa  579  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  63.94 
 
 		 418 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  63.7 
 
 		 417 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  63.37 
 
 		 416 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  62.86 
 
 		 420 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  54.11 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  50.24 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  46.79 
 
 		 424 aa  418  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  45.45 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  45.21 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  43.85 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  42.32 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  41.43 
 
 		 424 aa  345  8.999999999999999e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  39.61 
 
 		 421 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  37.2 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  37.26 
 
 		 419 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  36.12 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  33.9 
 
 		 427 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  34.87 
 
 		 421 aa  274  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  25.31 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  24.2 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  23.82 
 
 		 432 aa  82.8  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  23.33 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  25.2 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  25.75 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  24.74 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  28.38 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  24.02 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  25.71 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  25.71 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  25.53 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  23.51 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  22.73 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  25.47 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  24.31 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  24.25 
 
 		 480 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  26.33 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  23.12 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  22.25 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  22.47 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  24.6 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0749  aminotransferase class I and II  25.56 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000245467  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  25.19 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  25.19 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  26.79 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  23.17 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  21.78 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  24.08 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  27.06 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.23 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  22.33 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  22.53 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  24.06 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  21.63 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>