More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2500 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  82.01 
 
 		 417 aa  737    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  76.74 
 
 		 420 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  76.63 
 
 		 415 aa  689    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  76.74 
 
 		 419 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  82.93 
 
 		 417 aa  743    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 418 aa  866    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  76.39 
 
 		 416 aa  687    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  65.55 
 
 		 418 aa  591  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  64.1 
 
 		 417 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  64.81 
 
 		 417 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  62.83 
 
 		 421 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  64.42 
 
 		 416 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  62.59 
 
 		 456 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  64.82 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.100706 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  63.07 
 
 		 417 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  63.07 
 
 		 417 aa  570  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  63.94 
 
 		 416 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  63.7 
 
 		 416 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  63.07 
 
 		 417 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  63.07 
 
 		 417 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  63.94 
 
 		 416 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  63.7 
 
 		 416 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  63.7 
 
 		 416 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  63.07 
 
 		 417 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  63.07 
 
 		 417 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  63.07 
 
 		 417 aa  569  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  63.07 
 
 		 417 aa  570  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  63.07 
 
 		 417 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  62.17 
 
 		 416 aa  564  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  63.07 
 
 		 402 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  57 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  50.83 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  50.48 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  47.27 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  47.26 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  45.94 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  45.11 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  43.5 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  42.13 
 
 		 421 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  39.86 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  36.04 
 
 		 427 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  37.29 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  37.53 
 
 		 427 aa  306  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  36.17 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  26.32 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 411 aa  89.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  25.63 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 426 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  24.37 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  24.51 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  26.05 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  25.32 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  22.34 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  26.68 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  24.69 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  22.17 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  25.13 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  25.99 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  24.16 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  24.63 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  24.25 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  26.09 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  26.61 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  26.09 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  25.35 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  25.07 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  26.08 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  24.69 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  25.12 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  24.23 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  24.64 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  28.24 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  21.54 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  24.43 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  23.76 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  23.98 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0712  putative transcriptional regulator, GntR family  24.63 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0052998  normal  0.0161379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  25.44 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  23.23 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  28.76 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>