More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1090 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 427 aa  881    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  72.45 
 
 		 419 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  80.52 
 
 		 427 aa  735    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  71.19 
 
 		 421 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  65.33 
 
 		 427 aa  608  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  38.85 
 
 		 417 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  38.28 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  37.8 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  38.8 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  38.66 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  37.68 
 
 		 456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  37.92 
 
 		 421 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  37.29 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  36.69 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  38.22 
 
 		 440 aa  302  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.100706 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  36.06 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  35.82 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  35.58 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  35.58 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  36.19 
 
 		 417 aa  300  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  36.28 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  36.19 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  36.19 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  36.19 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  36.19 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  36.19 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  35.85 
 
 		 416 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  35.56 
 
 		 415 aa  296  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  36.06 
 
 		 416 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  35.71 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  35.56 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  38.5 
 
 		 402 aa  292  6e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  35.27 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  36.17 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  36.12 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  36.12 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  36.12 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  35.89 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  35.89 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  35.16 
 
 		 444 aa  285  8e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  36.34 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  34.09 
 
 		 443 aa  276  4e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  33.91 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  34.21 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 395 aa  103  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  25.37 
 
 		 392 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  23.84 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  22.72 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  25.68 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  27.2 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  24.88 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  24.82 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  26.86 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  26.2 
 
 		 410 aa  89.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  26.2 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  27.61 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  23.74 
 
 		 401 aa  87.4  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1353  L-aspartate aminotransferase  26.33 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0674  L-aspartate aminotransferase  23.75 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  22.91 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  27.11 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  26.23 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  25.86 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  24.08 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  24.02 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  25.81 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  25.86 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06472  aminotransferase  24.81 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  25.71 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  23.63 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3278  GntR family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  25.33 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  26.49 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  25.97 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  26.55 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  24.94 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0078  putative aminotransferase  25.24 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  25.64 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  23.23 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  27.76 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  23.02 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  25 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  25.08 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  24.8 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>