More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0962 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  100 
 
 
393 aa  791    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  79.34 
 
 
393 aa  651    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  80.61 
 
 
397 aa  674    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  79.08 
 
 
392 aa  626  1e-178  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  64.8 
 
 
399 aa  547  1e-154  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 
399 aa  298  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1088  aminotransferase class I and II  38.8 
 
 
399 aa  290  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  39.25 
 
 
411 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  35.04 
 
 
383 aa  236  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  34.95 
 
 
383 aa  229  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  34.29 
 
 
373 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  34.02 
 
 
393 aa  216  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  32.06 
 
 
379 aa  210  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  33.16 
 
 
380 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  32.23 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  32.38 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  32.51 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  32.21 
 
 
375 aa  197  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  34.21 
 
 
379 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  32.96 
 
 
393 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  30.98 
 
 
390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  31.36 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  32.32 
 
 
396 aa  196  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  32.49 
 
 
376 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  32.41 
 
 
393 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  31.97 
 
 
379 aa  192  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  31.68 
 
 
396 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.79 
 
 
377 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  33.25 
 
 
417 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.79 
 
 
377 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  31.96 
 
 
396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  35.07 
 
 
367 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  30.6 
 
 
377 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  31.75 
 
 
375 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  28.42 
 
 
392 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  31.09 
 
 
402 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  30.87 
 
 
392 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 
392 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  29.65 
 
 
392 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  32.74 
 
 
382 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  30.02 
 
 
395 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  31.79 
 
 
384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  31.5 
 
 
386 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  31.98 
 
 
381 aa  182  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  30.42 
 
 
384 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  30.33 
 
 
396 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  32.15 
 
 
375 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  33.8 
 
 
396 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  32.69 
 
 
393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  29.52 
 
 
393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  31.38 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 
409 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  30.16 
 
 
370 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.18 
 
 
396 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.36 
 
 
396 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  29.53 
 
 
396 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 
375 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  29.53 
 
 
396 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  28.32 
 
 
387 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  30.18 
 
 
396 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  30.18 
 
 
396 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  30.18 
 
 
396 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  30.18 
 
 
396 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  32.99 
 
 
412 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  30.42 
 
 
397 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  31.08 
 
 
388 aa  176  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  29.92 
 
 
396 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.18 
 
 
396 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  31.17 
 
 
397 aa  176  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  27.82 
 
 
402 aa  176  6e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  27.75 
 
 
400 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  30.59 
 
 
393 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  29.88 
 
 
400 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 
398 aa  176  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  32.14 
 
 
392 aa  176  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  28.5 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  31.94 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  31.87 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  31.67 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  32.69 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  31.2 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  28.27 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  30.05 
 
 
398 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.31 
 
 
404 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  28.94 
 
 
388 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  30.4 
 
 
402 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  30.92 
 
 
387 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  29.25 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  29.6 
 
 
404 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  30.83 
 
 
375 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  29.41 
 
 
396 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  28.75 
 
 
392 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  30.15 
 
 
402 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  28.03 
 
 
388 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  29.46 
 
 
392 aa  171  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  31.55 
 
 
388 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  30.91 
 
 
390 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  32.33 
 
 
407 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  31.2 
 
 
389 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>