More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2796 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  100 
 
 
409 aa  833    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  63.71 
 
 
396 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  63.87 
 
 
396 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  63.61 
 
 
396 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  62.76 
 
 
393 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  61.28 
 
 
395 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  61.99 
 
 
393 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  56.85 
 
 
396 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  46.61 
 
 
392 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  46.25 
 
 
392 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  39.29 
 
 
396 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  36.92 
 
 
395 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  37.34 
 
 
397 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1956  aminotransferase  36.48 
 
 
398 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.476214  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  35.29 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  35.23 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  30.1 
 
 
387 aa  242  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  35.11 
 
 
395 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 
395 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 
395 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 
407 aa  235  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 
395 aa  235  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  32.9 
 
 
395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  33.25 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  36.69 
 
 
396 aa  233  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  34.87 
 
 
390 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  33.07 
 
 
399 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  34.39 
 
 
379 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.05 
 
 
444 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  32.33 
 
 
388 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  32.36 
 
 
392 aa  229  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  31.93 
 
 
387 aa  229  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 
391 aa  229  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  33.43 
 
 
396 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  35.1 
 
 
387 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 
385 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  35.06 
 
 
398 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  32.81 
 
 
387 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  34.88 
 
 
405 aa  224  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  32.96 
 
 
400 aa  223  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  32.55 
 
 
383 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  34.11 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  35.34 
 
 
388 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  34.96 
 
 
398 aa  222  8e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  32.18 
 
 
386 aa  222  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  36.57 
 
 
399 aa  222  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  34.46 
 
 
393 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  33.25 
 
 
400 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  32.51 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  33.61 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  35.93 
 
 
401 aa  220  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 
386 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  34.84 
 
 
400 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  35.45 
 
 
400 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 
409 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  32.17 
 
 
389 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  34.45 
 
 
393 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  34.44 
 
 
393 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  35.23 
 
 
392 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  33.05 
 
 
398 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  32.75 
 
 
401 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 
400 aa  217  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  34.26 
 
 
400 aa  217  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  32.78 
 
 
402 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  33.24 
 
 
380 aa  216  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  36.19 
 
 
393 aa  216  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  32.95 
 
 
388 aa  215  9e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  35.2 
 
 
396 aa  215  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  35.69 
 
 
386 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  32.56 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  34.4 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  32.56 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  32.28 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  32.28 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  32.28 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  32.28 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  35.71 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  34.81 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  33.51 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  32.82 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  31.03 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  33.25 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  34.54 
 
 
388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  31.3 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  32.28 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  35.67 
 
 
390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  35.08 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  32.64 
 
 
393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
400 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 
400 aa  213  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
387 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>