More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0257 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 402 aa  824    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  56.06 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  51.15 
 
 		 399 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  52.19 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  50.64 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  53.65 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  51.02 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  49.36 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  51.17 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  47.31 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  48.16 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  48.48 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  52.54 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  48.22 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  48.48 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  48.36 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  48.72 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  48.21 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  49.74 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  49.74 
 
 		 392 aa  378  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  47.67 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  46.51 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  50.4 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  49.23 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  49.35 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  48.24 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  50 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  48.51 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  49.61 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  49.75 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  48.73 
 
 		 404 aa  368  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  46.75 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  50.39 
 
 		 388 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  45.2 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  51 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  52.24 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 		 400 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  48.57 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  46.58 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  49.37 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  47.61 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  47.78 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  49.61 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  49.24 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  48.72 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1189  aspartate aminotransferase, putative  51.18 
 
 		 384 aa  365  1e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.415311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  48.33 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  47.62 
 
 		 410 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  46.97 
 
 		 397 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  48.57 
 
 		 402 aa  362  6e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  48.83 
 
 		 400 aa  362  8e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  47.34 
 
 		 394 aa  362  8e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  47.56 
 
 		 400 aa  362  8e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  47.59 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  48.34 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  48.05 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  48.46 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  46.63 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  48.05 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  48.08 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  47.95 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  49.48 
 
 		 392 aa  358  7e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  48.47 
 
 		 403 aa  358  9e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  47 
 
 		 400 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  46.82 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  49.24 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  48.98 
 
 		 402 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  49.25 
 
 		 402 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  47.44 
 
 		 400 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  49.25 
 
 		 402 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  47.26 
 
 		 401 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  45.94 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  47 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  45.99 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  47.84 
 
 		 398 aa  353  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  47.41 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  45.22 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  46.92 
 
 		 400 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  48.21 
 
 		 396 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  49.5 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  47.18 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  47.45 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  46.23 
 
 		 409 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  48.84 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  46.94 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  46.15 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  44.96 
 
 		 392 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  46.46 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  48.61 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  48.61 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  47.57 
 
 		 397 aa  349  4e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  46.92 
 
 		 400 aa  349  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  46.41 
 
 		 400 aa  348  9e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  47.33 
 
 		 406 aa  348  9e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>