More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2905 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  100 
 
 		 395 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  73.66 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  72.89 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  73.4 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  72.82 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  71.79 
 
 		 393 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  61.28 
 
 		 409 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  59.9 
 
 		 396 aa  471  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  51.03 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  50.65 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  39.95 
 
 		 397 aa  289  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  37.91 
 
 		 396 aa  285  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  38.54 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  39.42 
 
 		 379 aa  255  9e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1956  aminotransferase  37.47 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.476214  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  35.14 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  35.77 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  37.07 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  35.38 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  34.24 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  37.13 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 		 410 aa  236  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  34.49 
 
 		 392 aa  236  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  36.46 
 
 		 407 aa  236  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  37.64 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  36.71 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  35.6 
 
 		 383 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  34.05 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  39.34 
 
 		 396 aa  233  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  36.84 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37.19 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  32.18 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  35.68 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  36.83 
 
 		 393 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  34.43 
 
 		 387 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  36.01 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  35.28 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  34.67 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  35.43 
 
 		 400 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  37.16 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  40.62 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  34.78 
 
 		 401 aa  226  6e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  35.62 
 
 		 400 aa  226  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  34.92 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  34.79 
 
 		 388 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  35.34 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  36.24 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  34.62 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  35.73 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  35.83 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  36.7 
 
 		 380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  35.01 
 
 		 398 aa  223  6e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  36.01 
 
 		 396 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  36.01 
 
 		 396 aa  222  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  33.16 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  35.73 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  35.73 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  35.73 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  35.73 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  35.73 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  35.05 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  35.46 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  34.92 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  36.58 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  35.73 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  33.67 
 
 		 401 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  34.46 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  34.91 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  34.91 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  34.63 
 
 		 400 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  33.87 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  35.44 
 
 		 395 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  34.08 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  38.23 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  35.45 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  37.4 
 
 		 404 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  39.73 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  33.52 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  33.98 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  35.18 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  35.29 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  35.18 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  37.95 
 
 		 401 aa  216  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 		 395 aa  216  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 		 395 aa  216  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  33.77 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  36.74 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  34.3 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  34.96 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  35.56 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  32.71 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  35.51 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  34.02 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>