More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0388 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  100 
 
 
392 aa  797    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  57.03 
 
 
390 aa  455  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  49.24 
 
 
395 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  48.23 
 
 
398 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  48.23 
 
 
397 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  48.36 
 
 
396 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  48.87 
 
 
397 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  48.09 
 
 
395 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  49.12 
 
 
397 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  47.57 
 
 
392 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  46.72 
 
 
401 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  46.35 
 
 
397 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  47.41 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  49.48 
 
 
388 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  46.35 
 
 
397 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  48.74 
 
 
398 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  48.59 
 
 
396 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  47.41 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  47.15 
 
 
395 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  47.27 
 
 
395 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  47.27 
 
 
395 aa  364  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  47.27 
 
 
395 aa  364  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  47.15 
 
 
395 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  47.27 
 
 
395 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  47.27 
 
 
395 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  47.69 
 
 
393 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  47.01 
 
 
395 aa  362  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  49.36 
 
 
398 aa  362  6e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  46.49 
 
 
395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  46.8 
 
 
393 aa  362  8e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  48.12 
 
 
399 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  46.29 
 
 
389 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  47.12 
 
 
399 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  45.27 
 
 
387 aa  358  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  46.31 
 
 
397 aa  358  7e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  47.62 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  46.06 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  46.31 
 
 
395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  46.13 
 
 
392 aa  353  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  44.42 
 
 
396 aa  352  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  45.27 
 
 
394 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  44.36 
 
 
400 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  48.96 
 
 
388 aa  350  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  45.71 
 
 
400 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  46.41 
 
 
400 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  46.15 
 
 
400 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  46.15 
 
 
400 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
397 aa  348  7e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  46.09 
 
 
394 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  44.5 
 
 
393 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  45.45 
 
 
397 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  44.87 
 
 
394 aa  345  6e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  43.5 
 
 
400 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  46.23 
 
 
390 aa  345  7e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 
401 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  44.58 
 
 
400 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  43.5 
 
 
400 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  44.87 
 
 
423 aa  343  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  42.53 
 
 
400 aa  343  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  43.75 
 
 
400 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  45.2 
 
 
400 aa  343  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  44.84 
 
 
400 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  48.21 
 
 
389 aa  340  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  45.01 
 
 
400 aa  339  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  43.73 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  45.13 
 
 
400 aa  338  8e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  45.13 
 
 
400 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 
400 aa  338  9e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  45.13 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  41.46 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  45.38 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  44.96 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  46.35 
 
 
388 aa  336  5e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  44.08 
 
 
400 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  45.22 
 
 
392 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 
400 aa  335  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  43.26 
 
 
399 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  45.24 
 
 
389 aa  335  9e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  45.2 
 
 
400 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  45.01 
 
 
391 aa  335  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  44.25 
 
 
400 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  45.09 
 
 
397 aa  334  2e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  45.13 
 
 
380 aa  334  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 
405 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  45.2 
 
 
397 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  44.84 
 
 
401 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  42.03 
 
 
399 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  43.88 
 
 
379 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  46.17 
 
 
396 aa  332  8e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  42.31 
 
 
392 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  45.15 
 
 
410 aa  331  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 
400 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  47.67 
 
 
389 aa  330  3e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  43.65 
 
 
402 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  42.57 
 
 
400 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  43.73 
 
 
400 aa  330  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  43.43 
 
 
400 aa  329  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  43.58 
 
 
400 aa  329  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  43.58 
 
 
400 aa  328  7e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  47.41 
 
 
389 aa  328  9e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>