More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1569 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  100 
 
 
398 aa  806    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  75.76 
 
 
397 aa  616  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  71.54 
 
 
398 aa  593  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  70.28 
 
 
393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  67.94 
 
 
395 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  65.66 
 
 
392 aa  539  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  65.91 
 
 
394 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  66.58 
 
 
393 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  65.05 
 
 
394 aa  525  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  64.72 
 
 
400 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  63.1 
 
 
393 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  63.1 
 
 
393 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  61.06 
 
 
394 aa  489  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  61.73 
 
 
392 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  62.05 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  61.11 
 
 
391 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  57.39 
 
 
401 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  56.6 
 
 
423 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  56.6 
 
 
394 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  56.68 
 
 
399 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  57.47 
 
 
400 aa  438  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  54.66 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  54.8 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  57.32 
 
 
400 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  56.82 
 
 
400 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  56.82 
 
 
400 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  57.07 
 
 
400 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  56.06 
 
 
400 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  54.71 
 
 
400 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  55.1 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  54.87 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  55.9 
 
 
400 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  56.23 
 
 
401 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  55.75 
 
 
400 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  55.64 
 
 
400 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  55.47 
 
 
400 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  55.22 
 
 
400 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  55.36 
 
 
400 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  54.2 
 
 
401 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  54.96 
 
 
400 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  56.09 
 
 
401 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  51.52 
 
 
397 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  54.45 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  54.04 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  53.65 
 
 
409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  54.34 
 
 
393 aa  401  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  53.38 
 
 
402 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  53.63 
 
 
402 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  54.04 
 
 
400 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  54.91 
 
 
403 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  54.41 
 
 
404 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  53.69 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  51.02 
 
 
395 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  53.54 
 
 
400 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  53.88 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  51.02 
 
 
395 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  51.28 
 
 
395 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  53.28 
 
 
400 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  51.28 
 
 
395 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  50 
 
 
395 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  51.28 
 
 
395 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  51.28 
 
 
395 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  51.28 
 
 
395 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  51.28 
 
 
395 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  51.28 
 
 
395 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  52.79 
 
 
396 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  52.66 
 
 
410 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  51.13 
 
 
395 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  53.05 
 
 
409 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  51.02 
 
 
395 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  52.63 
 
 
399 aa  388  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  48.87 
 
 
398 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  49.75 
 
 
402 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  51.77 
 
 
400 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  51.9 
 
 
413 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  50.12 
 
 
400 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  51.52 
 
 
400 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  51.39 
 
 
397 aa  379  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  48.48 
 
 
389 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
400 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  49.49 
 
 
396 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  51.03 
 
 
400 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  48.23 
 
 
392 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  47.61 
 
 
397 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  49.49 
 
 
400 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  49.24 
 
 
396 aa  378  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  52.5 
 
 
406 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  50.64 
 
 
400 aa  379  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  47.24 
 
 
387 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
402 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  48.85 
 
 
388 aa  376  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  49.24 
 
 
400 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  49.11 
 
 
398 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  50.25 
 
 
400 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  50.88 
 
 
387 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  48.99 
 
 
399 aa  375  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  48.6 
 
 
398 aa  376  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  47.84 
 
 
397 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
389 aa  378  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 
400 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>