More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0762 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  78 
 
 		 400 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  78 
 
 		 400 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  83.75 
 
 		 400 aa  697    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  79.5 
 
 		 400 aa  662    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 400 aa  827    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  78.5 
 
 		 400 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  72.68 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  72.18 
 
 		 401 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  71.93 
 
 		 400 aa  597  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  71.68 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  71.93 
 
 		 401 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  70.68 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  71.68 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  70.68 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  71.68 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  72.18 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  69.75 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  70.93 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  70.78 
 
 		 400 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  69.92 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  70.96 
 
 		 400 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  70.03 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  70.18 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  68.01 
 
 		 400 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  66.92 
 
 		 400 aa  558  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  66.42 
 
 		 400 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  64.5 
 
 		 400 aa  541  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  64.66 
 
 		 400 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  63.41 
 
 		 400 aa  534  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  64.16 
 
 		 400 aa  537  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  62.91 
 
 		 400 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  64.75 
 
 		 401 aa  533  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  63.16 
 
 		 400 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  64.16 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  62.91 
 
 		 400 aa  522  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  61.65 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  60.15 
 
 		 400 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  61.4 
 
 		 400 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  60.9 
 
 		 402 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  60.4 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  60.71 
 
 		 404 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  59.4 
 
 		 400 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  61.46 
 
 		 403 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  59.4 
 
 		 408 aa  485  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  62.66 
 
 		 400 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  58.7 
 
 		 409 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  55.81 
 
 		 410 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  58 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  56.14 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  57.51 
 
 		 409 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  55.5 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  55.64 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  56.22 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  57.44 
 
 		 394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  55.56 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  55.19 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  54.29 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  55.44 
 
 		 394 aa  438  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  55.56 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  57.33 
 
 		 392 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  54.06 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  57.29 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  57.07 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  56.15 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  53.79 
 
 		 399 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  53.63 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  52.3 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  55.19 
 
 		 393 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  56.56 
 
 		 393 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  53.06 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  53.55 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  52.51 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  55.08 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  54.82 
 
 		 392 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  53.92 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  51.88 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  53.57 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  52.27 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  55.42 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  52.02 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  51.41 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  48.99 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  48.87 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  51.92 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  53.06 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  49.35 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  49.36 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  49.61 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  49.49 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  50.13 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  48.47 
 
 		 402 aa  368  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  49.62 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  49.62 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  48.85 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  47.09 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  48.23 
 
 		 397 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>