More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1242 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 399 aa  820    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  87.72 
 
 		 399 aa  732    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  80.95 
 
 		 397 aa  675    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  74.44 
 
 		 397 aa  628  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  57.8 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  57.64 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  56.6 
 
 		 398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  56.68 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  56.27 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  56.71 
 
 		 393 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  55.81 
 
 		 392 aa  448  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  52.13 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  53.96 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  53.79 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  52.63 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  53.38 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  53.54 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  52.39 
 
 		 400 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  52.78 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  53.69 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  52.63 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  53.54 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  53.79 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  51.41 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  53.69 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  51.51 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  53.15 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  52.78 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  53.62 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  52.64 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  52.78 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  53.15 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  52.39 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  52.27 
 
 		 400 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  54.34 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  54.59 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  54.59 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  54.59 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  51.4 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  54.85 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  54.34 
 
 		 395 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  54.59 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  54.59 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  51.65 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  54.34 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  51.41 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  54.08 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  52.39 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  50.38 
 
 		 402 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  51.89 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  56.27 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  52.39 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  51.92 
 
 		 400 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  52.64 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  49.87 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  51.64 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  53.83 
 
 		 395 aa  408  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  52.14 
 
 		 401 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  51.74 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  50.13 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  52.16 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  49.62 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  51.51 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  50.88 
 
 		 400 aa  401  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  50.63 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  51.92 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  51.4 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  51 
 
 		 400 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  51.24 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  50.63 
 
 		 400 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  49.37 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  51.92 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  49.62 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  53.69 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  50.77 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  51.15 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  49.49 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  48.59 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  48.99 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  48.74 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  50.25 
 
 		 389 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  48.11 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  50.89 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  48.11 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  48.36 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  50.51 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  51.02 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  48.11 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  51.39 
 
 		 388 aa  391  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  49.75 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  48.74 
 
 		 400 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  50.76 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  48.23 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  47.46 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  49.24 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  48.76 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  48.74 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  49.24 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>