More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2047 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  100 
 
 
396 aa  821    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  69.11 
 
 
396 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  67.1 
 
 
399 aa  568  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  57.91 
 
 
397 aa  471  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  53.96 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  53.03 
 
 
399 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  53.45 
 
 
404 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  50.13 
 
 
402 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  49.36 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  52.19 
 
 
402 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 
400 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  48.85 
 
 
400 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  48.59 
 
 
400 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  47.97 
 
 
399 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  48.59 
 
 
400 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  48.08 
 
 
400 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  49.62 
 
 
400 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  49.62 
 
 
400 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  47.46 
 
 
402 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  49.49 
 
 
400 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  47.57 
 
 
400 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  49.62 
 
 
400 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  49.1 
 
 
400 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  48.34 
 
 
400 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  48.59 
 
 
400 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  48.85 
 
 
398 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  48.59 
 
 
400 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  47.85 
 
 
402 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  49.24 
 
 
398 aa  378  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  47.34 
 
 
402 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  48.59 
 
 
400 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  49.24 
 
 
401 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  48.08 
 
 
400 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  47.83 
 
 
400 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  48.85 
 
 
400 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  48.95 
 
 
400 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  49.36 
 
 
400 aa  376  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  47.06 
 
 
400 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  48.34 
 
 
400 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  49.23 
 
 
394 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  47.81 
 
 
395 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  46.95 
 
 
398 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  48.22 
 
 
401 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  48.21 
 
 
400 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  47.98 
 
 
403 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  50.13 
 
 
401 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  47.83 
 
 
400 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  48.19 
 
 
400 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  47.21 
 
 
401 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  46.72 
 
 
394 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  46.55 
 
 
400 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  46.06 
 
 
399 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 
399 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  46.46 
 
 
423 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  47.31 
 
 
378 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  45.75 
 
 
400 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  47.57 
 
 
400 aa  364  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  48.59 
 
 
389 aa  363  3e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  45.94 
 
 
402 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  45.8 
 
 
410 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  45.55 
 
 
396 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.04 
 
 
397 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  47.52 
 
 
395 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  46.33 
 
 
392 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  47.29 
 
 
400 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  46.92 
 
 
402 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1189  aspartate aminotransferase, putative  48.57 
 
 
384 aa  359  6e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.415311 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  46.67 
 
 
402 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  46.56 
 
 
404 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  44.27 
 
 
397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  46.29 
 
 
400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  47.19 
 
 
397 aa  355  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  44.92 
 
 
404 aa  355  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  45.92 
 
 
397 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  44.58 
 
 
395 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  43.78 
 
 
452 aa  354  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  44.87 
 
 
400 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  45.27 
 
 
400 aa  351  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  46.68 
 
 
392 aa  350  3e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  45.24 
 
 
396 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  46.68 
 
 
392 aa  349  5e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  46.19 
 
 
397 aa  349  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  45.71 
 
 
394 aa  347  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  41.79 
 
 
399 aa  347  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  44.9 
 
 
400 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  42.35 
 
 
398 aa  345  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  44.58 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  45.94 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  44.76 
 
 
397 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  45.2 
 
 
394 aa  342  8e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  45.01 
 
 
397 aa  342  9e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 
400 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  45.9 
 
 
402 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  45.36 
 
 
409 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  45.92 
 
 
391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>