More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2501 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  80.95 
 
 		 399 aa  675    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  86.22 
 
 		 399 aa  712    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 397 aa  816    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  82.37 
 
 		 397 aa  693    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  58.19 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  55.27 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  55.67 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  55.98 
 
 		 398 aa  461  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  55.3 
 
 		 401 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  52.39 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  54.8 
 
 		 398 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  53.92 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  54.57 
 
 		 392 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  52.51 
 
 		 398 aa  438  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  57.07 
 
 		 393 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  53.71 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  52.5 
 
 		 400 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  53.55 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  53.42 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  52.26 
 
 		 398 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  53.3 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  52.31 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  53.16 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  53.16 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  53.16 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  52.91 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  53.16 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  53.4 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  53.16 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  53.16 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  53.16 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  56.17 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  52.28 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  52.66 
 
 		 395 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  51.39 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  50.51 
 
 		 387 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  53.59 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  50.12 
 
 		 400 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  50.63 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  50.87 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  53.03 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  50.51 
 
 		 397 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  50.37 
 
 		 400 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  50.63 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  52.31 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  52.39 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  52.31 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  52.02 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  49.38 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  51.64 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  52.42 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  50.63 
 
 		 400 aa  405  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  51.39 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  50.9 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  49.23 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  47.47 
 
 		 389 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  50.38 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  51.27 
 
 		 391 aa  398  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  51.13 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  51.79 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  50.51 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  48.35 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  49.49 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  51.28 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  50.88 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  46.08 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  50.88 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  50.63 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  47.69 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  51.13 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  49.12 
 
 		 400 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  50.89 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  47.86 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  48.11 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  48.98 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  48.11 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  50 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  50.25 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  50 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  49.12 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  47.95 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  49.87 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  49.62 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  50 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  49.37 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  46.6 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  45.96 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  49.23 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  48.11 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  48.48 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  47.36 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  48.87 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  46.53 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>