More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1193 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 402 aa  830    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  83.97 
 
 		 399 aa  699    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  85.57 
 
 		 402 aa  704    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  84.54 
 
 		 402 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  75.06 
 
 		 402 aa  616  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1189  aspartate aminotransferase, putative  81.25 
 
 		 384 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.415311 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  73.54 
 
 		 378 aa  594  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  48.84 
 
 		 395 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  50.39 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  47.34 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  50.9 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  50 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  49.74 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  48.33 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  48.97 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  48.57 
 
 		 402 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  49.62 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  49.87 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  48.47 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  49.23 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  48.72 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  47.31 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  46.55 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  49.24 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  48.86 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  49.24 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  48.08 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  46.62 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  47.19 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  49.1 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  48.85 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  48.97 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  46.94 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  48.21 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  48.72 
 
 		 402 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  46.02 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  48.98 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  47.3 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  48.72 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  47.96 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  49.62 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  47.92 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  48.96 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  46.67 
 
 		 405 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  48.34 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  48.21 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  47.96 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  48.34 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  47.7 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  46.23 
 
 		 404 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  47.7 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  48.21 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  48.48 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  47.96 
 
 		 400 aa  363  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  48.33 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  46.94 
 
 		 395 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  46.94 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  46.94 
 
 		 395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  45.41 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  47.97 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  46.43 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  47.57 
 
 		 388 aa  360  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  48.01 
 
 		 452 aa  359  4e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  47.45 
 
 		 392 aa  359  4e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  45.5 
 
 		 404 aa  358  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  46.84 
 
 		 395 aa  358  7e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  43.15 
 
 		 399 aa  358  7e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  46.68 
 
 		 395 aa  358  7e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  48.96 
 
 		 403 aa  358  9e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  46.68 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  46.17 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  49.21 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  47.31 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  46.33 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  47.04 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  46.29 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  44.07 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  46.41 
 
 		 392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  45.66 
 
 		 397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  46.43 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  48.45 
 
 		 400 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  46.43 
 
 		 400 aa  356  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  45.92 
 
 		 400 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  46.08 
 
 		 395 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  46.08 
 
 		 395 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  46.08 
 
 		 395 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  46.08 
 
 		 395 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  46.08 
 
 		 395 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  45.9 
 
 		 402 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  45.27 
 
 		 400 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  45.1 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  45.1 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  45.78 
 
 		 410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  47.7 
 
 		 397 aa  352  5e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  47.3 
 
 		 389 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>