More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1232 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  100 
 
 		 404 aa  820    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  55.73 
 
 		 400 aa  464  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  58.44 
 
 		 400 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  59.18 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  57.76 
 
 		 400 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  58.16 
 
 		 400 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  56.89 
 
 		 400 aa  455  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  55.42 
 
 		 400 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  55.47 
 
 		 400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  55.22 
 
 		 400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  56.19 
 
 		 400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  55.42 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  56.17 
 
 		 400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  55.73 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  55.73 
 
 		 400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  56.49 
 
 		 400 aa  448  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  54.94 
 
 		 400 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  56.7 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  54.2 
 
 		 400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  55.01 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  55.67 
 
 		 400 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  56.23 
 
 		 400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  56.23 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  54.96 
 
 		 400 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  55.92 
 
 		 400 aa  443  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  55.08 
 
 		 400 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  54.29 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  54.21 
 
 		 401 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  55.27 
 
 		 401 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  55.47 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  53.57 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  53.03 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  53.79 
 
 		 400 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  53.54 
 
 		 400 aa  438  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  55.73 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  54.29 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  54.29 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  53.54 
 
 		 400 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  53.96 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  52.91 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  53.96 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  53.79 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  54.77 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  53.35 
 
 		 409 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  53.33 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  53.83 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  51.9 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  51.32 
 
 		 410 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  49.49 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  54.41 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  50.65 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  47.77 
 
 		 398 aa  398  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  52.19 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  47.03 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  51.84 
 
 		 400 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  50.13 
 
 		 409 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  51.93 
 
 		 402 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  54.03 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  51.59 
 
 		 411 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  52.76 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  47 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  54.59 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  45.86 
 
 		 397 aa  378  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  49.22 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  46.94 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  46.53 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  46.53 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  48.84 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  47.86 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  50 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  48.53 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  47.8 
 
 		 404 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  45.09 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  46.27 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  47.98 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  47.01 
 
 		 399 aa  359  4e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  48.98 
 
 		 403 aa  359  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  45.36 
 
 		 399 aa  358  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  48.58 
 
 		 402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  47.83 
 
 		 393 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5769  aminotransferase class I and II  51.51 
 
 		 423 aa  355  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274836 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  47.3 
 
 		 402 aa  354  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  50.51 
 
 		 389 aa  354  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  45.98 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  46.73 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  47.75 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  44.72 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  48.28 
 
 		 391 aa  345  8e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  45.5 
 
 		 402 aa  344  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  48.29 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  44.67 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  46.89 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  46.53 
 
 		 402 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  44.47 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0102  aminotransferase, class I and II  50.55 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.848816  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  43.93 
 
 		 389 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  43.11 
 
 		 398 aa  339  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  47.87 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>