More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2591 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  100 
 
 
400 aa  826    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  70 
 
 
400 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  71.72 
 
 
404 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  71.25 
 
 
402 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  52.39 
 
 
400 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  50 
 
 
400 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  51.13 
 
 
400 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  49.25 
 
 
400 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  49 
 
 
400 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  52.39 
 
 
400 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  51.15 
 
 
400 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  49.5 
 
 
400 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  49.5 
 
 
400 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  48.75 
 
 
401 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  50.25 
 
 
400 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  50.38 
 
 
400 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
400 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  51.02 
 
 
402 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  50.25 
 
 
400 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  50.5 
 
 
400 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  51.28 
 
 
402 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  51.15 
 
 
400 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  50 
 
 
400 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  51.27 
 
 
404 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  48 
 
 
400 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  48.75 
 
 
400 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  50.25 
 
 
400 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  50.76 
 
 
400 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  48 
 
 
400 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  51.25 
 
 
400 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  49 
 
 
400 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  50.76 
 
 
400 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  50 
 
 
400 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  51.39 
 
 
408 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  50.25 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  48 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  47.75 
 
 
400 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  51.26 
 
 
400 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  49.87 
 
 
401 aa  411  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  48.99 
 
 
400 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  48.99 
 
 
400 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  49.11 
 
 
410 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  48.99 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  51.75 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  48.49 
 
 
400 aa  403  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  48.5 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  48.74 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  48.61 
 
 
402 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  47.68 
 
 
409 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  47.59 
 
 
413 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  48.23 
 
 
400 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  45.96 
 
 
402 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  46.68 
 
 
406 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  46 
 
 
400 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  45.34 
 
 
398 aa  382  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  49.49 
 
 
402 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  44.75 
 
 
397 aa  374  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  44.19 
 
 
398 aa  374  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  44.67 
 
 
401 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  48.53 
 
 
404 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0102  aminotransferase, class I and II  51.77 
 
 
401 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.848816  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  46.92 
 
 
402 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  48.18 
 
 
402 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  44.9 
 
 
409 aa  364  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  47.09 
 
 
403 aa  364  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  44.02 
 
 
411 aa  362  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  46.92 
 
 
402 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  45.92 
 
 
402 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  42.71 
 
 
399 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  47.34 
 
 
406 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  41.84 
 
 
395 aa  349  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 
399 aa  346  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  43.22 
 
 
398 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  43.44 
 
 
402 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  42.31 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  43.72 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  41.31 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  43.94 
 
 
394 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  44.87 
 
 
393 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  43.19 
 
 
396 aa  334  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  42.61 
 
 
398 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  43.91 
 
 
399 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  41.69 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  43.72 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  40.97 
 
 
392 aa  325  6e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  44.5 
 
 
403 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 
400 aa  325  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  41.48 
 
 
397 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  40.3 
 
 
389 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  41.03 
 
 
394 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  41.01 
 
 
395 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  41.27 
 
 
395 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  41.31 
 
 
395 aa  322  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  41.27 
 
 
395 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  40.61 
 
 
395 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  42.31 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  40.66 
 
 
395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  40.76 
 
 
395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  41.01 
 
 
395 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  41.01 
 
 
395 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>