More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0312 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  100 
 
 
413 aa  838    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  83 
 
 
402 aa  682    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  70.35 
 
 
409 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  64.95 
 
 
410 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  69.47 
 
 
409 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  65.68 
 
 
411 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  59.49 
 
 
400 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  56.38 
 
 
400 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  58.29 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  57.51 
 
 
400 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  57.25 
 
 
400 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  57.25 
 
 
400 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  57.25 
 
 
400 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  57.11 
 
 
401 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  55.96 
 
 
400 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  56.22 
 
 
400 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  56.48 
 
 
400 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  55.58 
 
 
400 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  56.48 
 
 
400 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  56.48 
 
 
400 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  55.7 
 
 
400 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  56.05 
 
 
400 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  56.99 
 
 
400 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  55.84 
 
 
400 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  56.71 
 
 
402 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  56.22 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  54.81 
 
 
400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  56.96 
 
 
402 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  55.7 
 
 
401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  55.58 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  56.3 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  56.2 
 
 
400 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  58.99 
 
 
408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  55.44 
 
 
400 aa  448  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  56.46 
 
 
404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  54.52 
 
 
401 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  55.7 
 
 
400 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  55.18 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  55.15 
 
 
400 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  54.4 
 
 
400 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  55.7 
 
 
400 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  52.02 
 
 
397 aa  429  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  54.68 
 
 
400 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  51.65 
 
 
400 aa  431  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  56.91 
 
 
406 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  52.91 
 
 
400 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  54.36 
 
 
400 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  52.59 
 
 
400 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  51.77 
 
 
404 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  52.85 
 
 
400 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  52.85 
 
 
400 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
398 aa  421  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  52.59 
 
 
400 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  49.62 
 
 
398 aa  420  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  57.29 
 
 
402 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  52.15 
 
 
402 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  51.39 
 
 
400 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  54.68 
 
 
402 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  54.4 
 
 
403 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  53.83 
 
 
404 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
401 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  54.68 
 
 
400 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  53.56 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  55.3 
 
 
406 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  51.39 
 
 
402 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  52.17 
 
 
392 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  48.23 
 
 
399 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  47.59 
 
 
400 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  48.71 
 
 
394 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  49.62 
 
 
398 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  48.99 
 
 
399 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  51.9 
 
 
398 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  49.75 
 
 
402 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  50.39 
 
 
393 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5769  aminotransferase class I and II  51.24 
 
 
423 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  49.36 
 
 
397 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  50.67 
 
 
402 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  48.98 
 
 
398 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  50.51 
 
 
393 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.96 
 
 
397 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  47.31 
 
 
394 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  50.53 
 
 
402 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  48.33 
 
 
395 aa  363  3e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  51.66 
 
 
394 aa  363  4e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  48.85 
 
 
400 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  45.27 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  45.52 
 
 
423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  46.68 
 
 
392 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  46.17 
 
 
392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  49.1 
 
 
391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  50.63 
 
 
403 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  46.97 
 
 
396 aa  345  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  45.41 
 
 
402 aa  344  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  43.94 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  46.72 
 
 
378 aa  343  4e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  45.38 
 
 
399 aa  343  4e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  44.7 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  48.7 
 
 
389 aa  339  5e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  43.81 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  45.76 
 
 
402 aa  333  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>