More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1096 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  100 
 
 		 403 aa  815    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  52.3 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  50.75 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  49.87 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  51.28 
 
 		 409 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  49.11 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  49.11 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  48.96 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  49.36 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  49.13 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  48.5 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  48.85 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  50.5 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  47.45 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  48.98 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  48.5 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  48.6 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  48.6 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  47.58 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  47.09 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  47.33 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  48.25 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  47.33 
 
 		 400 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  47.07 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  48.87 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  46.63 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  46.9 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  49.87 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  46.63 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  46.82 
 
 		 400 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  48.09 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  49.37 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  48.24 
 
 		 402 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  48.11 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  49.87 
 
 		 411 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  47.75 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  46.25 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  46.82 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  46.13 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  48.24 
 
 		 402 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  50.63 
 
 		 413 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  46.82 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  48.24 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  46.56 
 
 		 400 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  45.64 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  47.25 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  44.39 
 
 		 401 aa  362  8e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  46.06 
 
 		 400 aa  359  4e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  48.49 
 
 		 402 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 		 400 aa  358  9e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  47.88 
 
 		 395 aa  354  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  47.58 
 
 		 404 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  46.88 
 
 		 393 aa  349  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  44.39 
 
 		 400 aa  348  8e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  46.48 
 
 		 403 aa  345  7e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  45.38 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  43.97 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  47.09 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  46.08 
 
 		 402 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  43.94 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  45.41 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  40.75 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  45.86 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  45.06 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  45.25 
 
 		 400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  46.19 
 
 		 389 aa  336  5e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  41.96 
 
 		 397 aa  335  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  48.88 
 
 		 406 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 		 399 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  45.14 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  40.75 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  42.46 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  46.55 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  41.96 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  46.06 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  43.48 
 
 		 398 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  44.97 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  49.48 
 
 		 402 aa  328  9e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  45.14 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  45.66 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0102  aminotransferase, class I and II  50.14 
 
 		 401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.848816  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  43.47 
 
 		 394 aa  325  6e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  45.2 
 
 		 402 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  46.03 
 
 		 402 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  44.05 
 
 		 392 aa  322  5e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  43.8 
 
 		 392 aa  322  8e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  41.1 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  44.86 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  45.54 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  44.61 
 
 		 394 aa  319  5e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  42.53 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  45.23 
 
 		 452 aa  318  9e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  44.65 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  41.5 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  42.61 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  44.56 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  42.36 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  41.01 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>