More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3244 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  100 
 
 
402 aa  813    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  55.24 
 
 
400 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  55.24 
 
 
400 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  54.22 
 
 
400 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  52.87 
 
 
404 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  53.9 
 
 
400 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  50.9 
 
 
400 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  50.64 
 
 
400 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  53.32 
 
 
400 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  48.85 
 
 
400 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  53.79 
 
 
402 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  51.41 
 
 
400 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  51.92 
 
 
400 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  49.75 
 
 
400 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  51.26 
 
 
400 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
400 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  51.5 
 
 
406 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  54.03 
 
 
404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  51.01 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  50 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  49.5 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  51.01 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  49.24 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  49.1 
 
 
400 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  50 
 
 
402 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  50.64 
 
 
404 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  49.23 
 
 
400 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  51.77 
 
 
400 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 
401 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  49.23 
 
 
400 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  50.64 
 
 
400 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  49.37 
 
 
410 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  49.5 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 
401 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  48.97 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  49.49 
 
 
402 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  48.35 
 
 
400 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  49.75 
 
 
400 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0102  aminotransferase, class I and II  56.12 
 
 
401 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.848816  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  49.25 
 
 
400 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  48.7 
 
 
400 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  48.61 
 
 
400 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  47.36 
 
 
400 aa  389  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  51.19 
 
 
408 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  52.43 
 
 
402 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  49.11 
 
 
409 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  50.63 
 
 
402 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
402 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  48.04 
 
 
400 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  50.67 
 
 
413 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  48.92 
 
 
409 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  48.62 
 
 
403 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  46.53 
 
 
401 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  46.67 
 
 
401 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  47.68 
 
 
411 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  46.38 
 
 
402 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  46.63 
 
 
402 aa  359  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  44.7 
 
 
399 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  48.84 
 
 
398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  47.22 
 
 
402 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  48.62 
 
 
406 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  47.21 
 
 
400 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  44.44 
 
 
389 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  43.43 
 
 
399 aa  346  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  43.51 
 
 
394 aa  345  7e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  44.89 
 
 
402 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5769  aminotransferase class I and II  48.12 
 
 
423 aa  342  7e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274836 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 
395 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 
395 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  43 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  43.26 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  43.33 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  42.03 
 
 
395 aa  338  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  46.33 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  43.52 
 
 
396 aa  337  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  42.49 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  42.49 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  42.49 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  42.49 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  42.49 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 
395 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  44.1 
 
 
392 aa  336  5e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  44.61 
 
 
393 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 
397 aa  335  7e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  45.09 
 
 
406 aa  335  9e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  46.46 
 
 
397 aa  333  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  42.24 
 
 
395 aa  332  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  40.87 
 
 
398 aa  332  8e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  44.56 
 
 
396 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  44.02 
 
 
395 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  43.18 
 
 
397 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>