More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0102 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0102  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
401 aa  801    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.848816  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  56.12 
 
 
402 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  52.56 
 
 
404 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
400 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
400 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  50.51 
 
 
400 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  48.33 
 
 
400 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  50.25 
 
 
400 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  47.3 
 
 
400 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  48.06 
 
 
400 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  47.04 
 
 
400 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  47.56 
 
 
400 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  51.54 
 
 
402 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  46.55 
 
 
400 aa  377  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  46.39 
 
 
400 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  49.1 
 
 
400 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  47.04 
 
 
400 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  48.33 
 
 
400 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  49.24 
 
 
400 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  46.53 
 
 
400 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  45.76 
 
 
400 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  46.53 
 
 
400 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  45.76 
 
 
400 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  48.99 
 
 
400 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  47.22 
 
 
400 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  46.27 
 
 
400 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  47.47 
 
 
400 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  50 
 
 
404 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  46.46 
 
 
400 aa  363  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  45.2 
 
 
400 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  46.19 
 
 
406 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  45.59 
 
 
401 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  45.9 
 
 
400 aa  362  9e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  44.95 
 
 
400 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  46.79 
 
 
400 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  46.68 
 
 
400 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 
400 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  45.96 
 
 
400 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  45.22 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  47.72 
 
 
408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  44.95 
 
 
400 aa  356  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  46.79 
 
 
400 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  44.33 
 
 
401 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  45.41 
 
 
400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  46.92 
 
 
402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  46.92 
 
 
402 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  47.45 
 
 
402 aa  352  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  46.7 
 
 
404 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  46.33 
 
 
402 aa  348  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  45.2 
 
 
400 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  46.19 
 
 
403 aa  346  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  43.77 
 
 
401 aa  347  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  45.2 
 
 
400 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  49.47 
 
 
413 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  45.2 
 
 
400 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  45.66 
 
 
410 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  46.43 
 
 
409 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  44.27 
 
 
400 aa  341  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  50.26 
 
 
406 aa  338  7e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  49.36 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  46.17 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  44.9 
 
 
401 aa  335  9e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  43.32 
 
 
400 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  46.22 
 
 
409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  48.73 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  41.92 
 
 
392 aa  326  5e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  41.62 
 
 
398 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  46.41 
 
 
411 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  40.76 
 
 
397 aa  323  3e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  40.51 
 
 
394 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  42.13 
 
 
395 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  44.9 
 
 
402 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 
399 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  39.8 
 
 
395 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  41.73 
 
 
396 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  38.54 
 
 
395 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  39.75 
 
 
389 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  39.8 
 
 
395 aa  315  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  44.05 
 
 
402 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  39.09 
 
 
395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  39.09 
 
 
395 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0758  aspartate aminotransferase  41.33 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  44.87 
 
 
402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  39.55 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  39.55 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  39.55 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  39.49 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  39.55 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  43.04 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  39.55 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  39.18 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  43.51 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  39.13 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  43.37 
 
 
402 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 
402 aa  312  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  41.48 
 
 
394 aa  312  7.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  43.56 
 
 
402 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  42.57 
 
 
393 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  42.17 
 
 
397 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  38.89 
 
 
395 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>