More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6360 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  81.3 
 
 
402 aa  666    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  100 
 
 
402 aa  822    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  74.13 
 
 
402 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  56.75 
 
 
400 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  57.11 
 
 
402 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  56.86 
 
 
402 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  56.42 
 
 
404 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  53.75 
 
 
400 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  54.25 
 
 
400 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  53.65 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  53.75 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  53.25 
 
 
401 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  54.06 
 
 
400 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  54 
 
 
400 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  56.71 
 
 
402 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  54.5 
 
 
406 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  56.53 
 
 
408 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  53.73 
 
 
402 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  52 
 
 
400 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  52.25 
 
 
400 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  53.5 
 
 
401 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  51.5 
 
 
400 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  52.25 
 
 
400 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  52 
 
 
400 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  51.25 
 
 
400 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  52 
 
 
400 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  55.98 
 
 
402 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  53.63 
 
 
400 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5769  aminotransferase class I and II  57.04 
 
 
423 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  51.63 
 
 
400 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  54.1 
 
 
400 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  52.63 
 
 
400 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  52.78 
 
 
400 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  51.92 
 
 
401 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  51.13 
 
 
410 aa  424  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  54.68 
 
 
413 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  53.59 
 
 
400 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  53.59 
 
 
400 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  51.38 
 
 
400 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  53.03 
 
 
400 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  51.37 
 
 
400 aa  421  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  54.11 
 
 
402 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  50.25 
 
 
400 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  51.88 
 
 
400 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  53.5 
 
 
400 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  50.88 
 
 
400 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  52.49 
 
 
401 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  50.63 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  53.24 
 
 
409 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  51.5 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  50.63 
 
 
400 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  50.88 
 
 
400 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  50.63 
 
 
400 aa  410  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  51.39 
 
 
409 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  52.19 
 
 
404 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  51.89 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  49.5 
 
 
400 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  49 
 
 
400 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  51.02 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  50 
 
 
397 aa  396  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  47.49 
 
 
399 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  50.64 
 
 
411 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  47.49 
 
 
399 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  51.92 
 
 
393 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  51.25 
 
 
400 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  48.47 
 
 
394 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21440  aspartate aminotransferase  52.24 
 
 
405 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.595077  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  46.62 
 
 
398 aa  383  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  49.63 
 
 
398 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  48.75 
 
 
400 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  48.11 
 
 
398 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  47.97 
 
 
394 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
394 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 
395 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  50.76 
 
 
393 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  50.76 
 
 
406 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  48.5 
 
 
400 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  47.86 
 
 
404 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  46.37 
 
 
398 aa  377  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  48.74 
 
 
397 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  46.23 
 
 
397 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  48.76 
 
 
402 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
391 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  47.31 
 
 
392 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  47.57 
 
 
392 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  44.97 
 
 
397 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  46.48 
 
 
400 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  46.98 
 
 
398 aa  360  4e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  45.92 
 
 
400 aa  359  5e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  45.55 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 
394 aa  356  5e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  46.4 
 
 
402 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  45.98 
 
 
397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  45.23 
 
 
398 aa  352  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  47.22 
 
 
402 aa  352  8e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  48.24 
 
 
389 aa  350  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  43.48 
 
 
397 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  46.85 
 
 
396 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  45.36 
 
 
389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0758  aspartate aminotransferase  42.46 
 
 
397 aa  340  2e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>