More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1297 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  76.19 
 
 		 400 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  89.25 
 
 		 401 aa  743    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  95.5 
 
 		 400 aa  793    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  90 
 
 		 400 aa  760    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 400 aa  826    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  93.25 
 
 		 401 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  96.25 
 
 		 400 aa  802    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  92.75 
 
 		 400 aa  781    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  74.75 
 
 		 400 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  75.25 
 
 		 400 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  74.25 
 
 		 400 aa  622  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  74.5 
 
 		 400 aa  623  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  75 
 
 		 400 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  73.5 
 
 		 400 aa  620  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  73.75 
 
 		 400 aa  620  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  74.24 
 
 		 400 aa  614  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  72.43 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  71.93 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  71.93 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  71 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  71.68 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  71.75 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  71.68 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  69.92 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  70.93 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  69.5 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  69.42 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  70.18 
 
 		 400 aa  584  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  69.42 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  69.25 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  68.75 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  69.25 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  66.5 
 
 		 400 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  67.66 
 
 		 400 aa  558  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  65.5 
 
 		 400 aa  552  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  65.84 
 
 		 401 aa  541  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  65.05 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  64.39 
 
 		 404 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  64.8 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  62.25 
 
 		 400 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  64.32 
 
 		 408 aa  521  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  62.5 
 
 		 400 aa  518  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  61 
 
 		 400 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  59.33 
 
 		 410 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  60.35 
 
 		 403 aa  484  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  59.9 
 
 		 401 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  59.74 
 
 		 409 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  57.44 
 
 		 402 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  55.39 
 
 		 398 aa  472  1e-132  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  54.39 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  55.84 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  57.25 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  56.63 
 
 		 409 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  55.42 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  56.38 
 
 		 402 aa  454  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  59.5 
 
 		 400 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  54.5 
 
 		 400 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  53.52 
 
 		 404 aa  451  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  54.25 
 
 		 402 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  55.5 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  54.48 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  54.66 
 
 		 411 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  52.67 
 
 		 402 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  53.75 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  54.43 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  49.25 
 
 		 400 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  54.04 
 
 		 398 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  53.3 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  52.05 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  51.89 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  55.47 
 
 		 398 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  53.06 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  51.64 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  54.57 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  53.55 
 
 		 392 aa  411  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  54.02 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  54.22 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  52.41 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  51.13 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  55.56 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  55.3 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  53.71 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  51.39 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  50 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  52.66 
 
 		 391 aa  388  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  50 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  48.08 
 
 		 402 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  49.1 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  48.59 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  48.84 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  50.25 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  46.53 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  47.86 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  46.72 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  50.38 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  48.98 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5769  aminotransferase class I and II  49.63 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  48.59 
 
 		 396 aa  362  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  47.86 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>