More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2202 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  100 
 
 
393 aa  807    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  72.41 
 
 
395 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  70.28 
 
 
398 aa  577  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  68.19 
 
 
394 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  68.43 
 
 
397 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  67.35 
 
 
392 aa  548  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  67.53 
 
 
393 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  63.22 
 
 
398 aa  521  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  66.49 
 
 
400 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  65.31 
 
 
394 aa  511  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  63.12 
 
 
394 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  64.43 
 
 
391 aa  504  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  63.31 
 
 
392 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  62.79 
 
 
392 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  63.5 
 
 
393 aa  488  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  63.5 
 
 
393 aa  488  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  59.38 
 
 
401 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  56.63 
 
 
394 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  56.63 
 
 
423 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  52.31 
 
 
397 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  57.07 
 
 
400 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  57.07 
 
 
400 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  57.07 
 
 
400 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  51.65 
 
 
399 aa  428  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  51.41 
 
 
399 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  56.56 
 
 
400 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  53.94 
 
 
400 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  54.71 
 
 
400 aa  421  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  54.73 
 
 
400 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  54.76 
 
 
400 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  53.06 
 
 
402 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  53.06 
 
 
402 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  55.24 
 
 
400 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  52.01 
 
 
404 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  54.76 
 
 
400 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  53.71 
 
 
400 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  54.48 
 
 
401 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  53.96 
 
 
400 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  50.89 
 
 
398 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  51.52 
 
 
409 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  53.45 
 
 
400 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  54.22 
 
 
400 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  52.66 
 
 
403 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  52.21 
 
 
400 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  52.94 
 
 
400 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  52.44 
 
 
401 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  53.25 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  53.45 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  52.44 
 
 
400 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  52.42 
 
 
401 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  51.77 
 
 
408 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  49.62 
 
 
410 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  52.96 
 
 
400 aa  391  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  52.44 
 
 
400 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  52.96 
 
 
400 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  52.7 
 
 
400 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
400 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  48.85 
 
 
395 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  51.67 
 
 
400 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  48.72 
 
 
402 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  48.48 
 
 
397 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  49.74 
 
 
397 aa  383  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  49.23 
 
 
395 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  49.23 
 
 
395 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  50.39 
 
 
413 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  51.66 
 
 
400 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  51.92 
 
 
402 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
400 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  51.55 
 
 
393 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  48.97 
 
 
402 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  50.52 
 
 
396 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 
402 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  48.46 
 
 
395 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  48.46 
 
 
395 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  48.46 
 
 
395 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  49.75 
 
 
402 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 
400 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  49.48 
 
 
400 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  48.46 
 
 
395 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
400 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  48.46 
 
 
395 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  48.72 
 
 
395 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  48.48 
 
 
395 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  51.03 
 
 
400 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  48.46 
 
 
395 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  51.03 
 
 
400 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  50 
 
 
400 aa  376  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  48.96 
 
 
409 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  48.48 
 
 
395 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  46.33 
 
 
398 aa  372  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
400 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  49.1 
 
 
389 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  48.22 
 
 
400 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  48.22 
 
 
400 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  49.24 
 
 
402 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  48.46 
 
 
396 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  48.22 
 
 
400 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  46.58 
 
 
398 aa  369  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  48.08 
 
 
398 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>