More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0755 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 395 aa  808    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  61.68 
 
 		 395 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  56.23 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  54.2 
 
 		 399 aa  464  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  56.09 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  55.22 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  54.22 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  52.67 
 
 		 395 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  53.05 
 
 		 396 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  53.71 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  54.45 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  51.91 
 
 		 395 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  51.4 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  51.4 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  51.65 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  51.65 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  51.65 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  51.65 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  53.67 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  51.65 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  54.2 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  51.65 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  53.94 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  53.42 
 
 		 397 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  53.69 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  51.65 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  51.66 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  50.13 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  49.74 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  50.64 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  49.24 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  47.46 
 
 		 389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  47.58 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  50 
 
 		 407 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  47.72 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  46.58 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  51.13 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  48.6 
 
 		 388 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  51.16 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  50 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  49.23 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  48.47 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  49.62 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  49.35 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  49.75 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  49.35 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  48.21 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  49.36 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  48.84 
 
 		 402 aa  381  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  49.61 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  49.35 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  49.35 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  48.61 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  48.09 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  47.69 
 
 		 398 aa  378  1e-104  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  49.35 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  49.37 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  47.81 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  44.78 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  48.85 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  48.61 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  48.35 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  45.82 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  48.87 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  49.35 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  49.87 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  48.09 
 
 		 392 aa  378  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  44.78 
 
 		 405 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  47.3 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  47.81 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  48.22 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  47.44 
 
 		 402 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  47.96 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  48.12 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  47.3 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  47.86 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  48.31 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  47.86 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  47.44 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  47.36 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  49.2 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  43.15 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  46.92 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  46.79 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  45.66 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  47.61 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  48.86 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  48.35 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  45.97 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  46.48 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  45.66 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  46.75 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  42.75 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  46.13 
 
 		 409 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>