More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0135 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 407 aa  834    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  50 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  51.13 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  51.01 
 
 		 397 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  48.75 
 
 		 395 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  48.1 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  47.87 
 
 		 388 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  49.87 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  48.75 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  49.25 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  47.59 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  47.98 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  46.37 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  47.38 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  48.61 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  48.11 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  48.11 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  47.49 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  45.73 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  46.75 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  47.09 
 
 		 400 aa  359  6e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  44.31 
 
 		 390 aa  359  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  45.86 
 
 		 397 aa  358  9e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  47.12 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  47.12 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  47.12 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  47.12 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  47.12 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  46.87 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  47.1 
 
 		 400 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  47.87 
 
 		 400 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  44.7 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  45.82 
 
 		 401 aa  356  3.9999999999999996e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  47.16 
 
 		 400 aa  355  5.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  46.87 
 
 		 395 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  46.1 
 
 		 389 aa  354  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  46.4 
 
 		 401 aa  355  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  46.12 
 
 		 400 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  46.62 
 
 		 395 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  45.86 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  46.87 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  46.37 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  46.37 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  43.86 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  45.36 
 
 		 405 aa  353  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  46.23 
 
 		 400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  46.15 
 
 		 400 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  47.37 
 
 		 401 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  45.61 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  47.99 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  44.11 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  46.12 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  43.97 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  46.85 
 
 		 400 aa  349  5e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  45.66 
 
 		 400 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  44.08 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  47.12 
 
 		 400 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  46.37 
 
 		 400 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  46.62 
 
 		 401 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  44.47 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  44.22 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  47.12 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  41.77 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  46.62 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  45.52 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  46.68 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  45.95 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  46.19 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  46.37 
 
 		 400 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  46.93 
 
 		 397 aa  345  7e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  43.97 
 
 		 400 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  42.71 
 
 		 400 aa  344  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  45.52 
 
 		 398 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  45.38 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  44.67 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  44.61 
 
 		 406 aa  344  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  45.93 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  44.91 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  44.94 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  44.86 
 
 		 400 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  46.4 
 
 		 415 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  46.37 
 
 		 392 aa  342  7e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  45.86 
 
 		 400 aa  342  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  45.86 
 
 		 397 aa  342  8e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  46.12 
 
 		 392 aa  342  9e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  44.86 
 
 		 401 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  45.11 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  44.61 
 
 		 400 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  45.61 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  43.86 
 
 		 400 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  43.36 
 
 		 388 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  45.43 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  45.98 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  43.11 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  43.22 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  44.16 
 
 		 399 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  44.11 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  44.89 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  43.58 
 
 		 390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>