More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0566 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 402 aa  810    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  86.78 
 
 		 402 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  71.32 
 
 		 405 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  72.07 
 
 		 402 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  69.46 
 
 		 406 aa  578  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  71.72 
 
 		 401 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  72.54 
 
 		 415 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  71.46 
 
 		 401 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  68.86 
 
 		 402 aa  556  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  69.52 
 
 		 400 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  69.52 
 
 		 411 aa  548  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  69.52 
 
 		 460 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  70.38 
 
 		 415 aa  544  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  66.75 
 
 		 410 aa  540  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  70.05 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  65.66 
 
 		 411 aa  534  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  67.58 
 
 		 405 aa  534  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  69.95 
 
 		 412 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  65.34 
 
 		 409 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  69.1 
 
 		 413 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  63.89 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  56.68 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  57.03 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  57.07 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  47.34 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.76 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  48.24 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  47.89 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  44.27 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  48.1 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  48.07 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  48.1 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  46.85 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  44.81 
 
 		 397 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 		 395 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  43.51 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  44.27 
 
 		 395 aa  363  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  46.79 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  46.63 
 
 		 401 aa  362  9e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  44.92 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  44.92 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  44.92 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  44.92 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  44.92 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  46.62 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  46.62 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  46.33 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  48.35 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  46.37 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  44.99 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  44.02 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  44.67 
 
 		 395 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  43 
 
 		 390 aa  358  7e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  47.07 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  45.55 
 
 		 388 aa  353  4e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  45.86 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  44.25 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  42.86 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  47.58 
 
 		 390 aa  349  5e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  43.15 
 
 		 387 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  46.13 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  45.88 
 
 		 402 aa  346  4e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  39.34 
 
 		 399 aa  346  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  43.72 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  44.94 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  45.18 
 
 		 400 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  40.72 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 		 400 aa  342  9e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  43.07 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  43.48 
 
 		 399 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  46.68 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  43.36 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  44.07 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  44.92 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  45.1 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  43.36 
 
 		 400 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  44.85 
 
 		 402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  45.45 
 
 		 400 aa  339  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  45.29 
 
 		 393 aa  338  8e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  43.11 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  45.8 
 
 		 388 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  45.06 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  44.05 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  43.58 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  44.94 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  44.92 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  42.36 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  42.11 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  42.64 
 
 		 393 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  46.68 
 
 		 402 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  43.8 
 
 		 401 aa  332  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  42.53 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  42.49 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  43 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  44.05 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  42.75 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>