More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0535 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  83.71 
 
 
402 aa  669    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  100 
 
 
401 aa  809    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  82.96 
 
 
405 aa  677    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  88.03 
 
 
401 aa  700    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  85.18 
 
 
406 aa  693    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  80.1 
 
 
415 aa  625  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  79.04 
 
 
400 aa  623  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  76.4 
 
 
415 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  72.54 
 
 
410 aa  590  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  74.44 
 
 
412 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  72.93 
 
 
460 aa  586  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  73.12 
 
 
411 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  71.68 
 
 
411 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  71.6 
 
 
405 aa  578  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  73.74 
 
 
402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  71.46 
 
 
402 aa  567  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  70.62 
 
 
409 aa  567  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  71.14 
 
 
402 aa  567  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  72.11 
 
 
413 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  72.43 
 
 
415 aa  558  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  63.04 
 
 
414 aa  525  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  60.15 
 
 
401 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  57.11 
 
 
412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  53.52 
 
 
398 aa  404  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  46.06 
 
 
395 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  45.55 
 
 
397 aa  371  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  47.86 
 
 
393 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  46.21 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  46.21 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  46.21 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  46.21 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  45.32 
 
 
397 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  46.21 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  46.21 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.76 
 
 
397 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  45.71 
 
 
395 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  45.71 
 
 
395 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  44.95 
 
 
395 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  47.98 
 
 
398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  46.6 
 
 
397 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  46.84 
 
 
396 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  45.2 
 
 
395 aa  358  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  44.95 
 
 
395 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  45.82 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  46.46 
 
 
401 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  45.04 
 
 
389 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  46.33 
 
 
400 aa  352  5e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  44.53 
 
 
388 aa  352  5.9999999999999994e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  44.76 
 
 
399 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  46.58 
 
 
400 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  43.4 
 
 
387 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  44.86 
 
 
407 aa  347  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  40.98 
 
 
395 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  46.33 
 
 
400 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  46.33 
 
 
400 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  45.88 
 
 
402 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  44.78 
 
 
393 aa  346  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  43.36 
 
 
399 aa  345  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  46.73 
 
 
404 aa  345  6e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  40.97 
 
 
390 aa  345  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  46.06 
 
 
390 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  39.65 
 
 
399 aa  344  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  43.65 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  45.71 
 
 
400 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  44.72 
 
 
398 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  44.72 
 
 
400 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  41.27 
 
 
398 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  43.91 
 
 
400 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  44.62 
 
 
396 aa  339  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  44.42 
 
 
400 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  42.96 
 
 
400 aa  338  7e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  46.43 
 
 
397 aa  338  8e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  43.51 
 
 
390 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  45.09 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  46.36 
 
 
378 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 
402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  43.83 
 
 
400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 
393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  42.75 
 
 
395 aa  336  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  43.91 
 
 
400 aa  335  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  43.33 
 
 
399 aa  335  7e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  41.81 
 
 
394 aa  335  7e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  44.73 
 
 
392 aa  335  7e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  44.53 
 
 
402 aa  335  7e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  43.22 
 
 
401 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  43.07 
 
 
393 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  43.15 
 
 
400 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  43.65 
 
 
394 aa  334  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  42.89 
 
 
400 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  43.65 
 
 
400 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  46.06 
 
 
390 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  41.62 
 
 
389 aa  333  4e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  41.98 
 
 
397 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  43.22 
 
 
400 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  42.46 
 
 
400 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  44.27 
 
 
388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  42.71 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  43.78 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  44.27 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>