More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1011 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  100 
 
 
412 aa  830    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  74.13 
 
 
406 aa  616  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  75.51 
 
 
400 aa  598  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  74.44 
 
 
401 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  74.25 
 
 
402 aa  591  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  74.44 
 
 
401 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  71.25 
 
 
405 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  73.35 
 
 
415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  69.27 
 
 
411 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  73.18 
 
 
460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  74.94 
 
 
413 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  73.74 
 
 
402 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  69.76 
 
 
411 aa  565  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  72.98 
 
 
415 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  66.91 
 
 
410 aa  549  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  71.04 
 
 
415 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  67.85 
 
 
402 aa  545  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  69.95 
 
 
402 aa  542  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  68.5 
 
 
405 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  68 
 
 
409 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  61.63 
 
 
414 aa  510  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  58.27 
 
 
401 aa  458  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  54.81 
 
 
412 aa  443  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  53.42 
 
 
398 aa  385  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  47.22 
 
 
398 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
395 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  48.09 
 
 
401 aa  362  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  46.6 
 
 
389 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  46.06 
 
 
388 aa  361  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  46.7 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  47.84 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  46.56 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  46.02 
 
 
397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  43.07 
 
 
390 aa  355  6.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.01 
 
 
397 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  47.19 
 
 
392 aa  351  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  47.22 
 
 
400 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  48.35 
 
 
390 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  42.75 
 
 
397 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  43.8 
 
 
387 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  46.31 
 
 
401 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  45.25 
 
 
396 aa  342  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  46.08 
 
 
400 aa  342  7e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  45.06 
 
 
400 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  40.56 
 
 
399 aa  340  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  42.24 
 
 
397 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  43.77 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  46.63 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  45.94 
 
 
390 aa  339  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  48.21 
 
 
390 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  47.36 
 
 
404 aa  339  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  45.57 
 
 
400 aa  338  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  46.31 
 
 
393 aa  338  8e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  45.57 
 
 
400 aa  338  8e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  43.26 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  45.32 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  46.23 
 
 
400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  45.57 
 
 
388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  42.49 
 
 
395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  45.71 
 
 
400 aa  335  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 
400 aa  335  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  45.08 
 
 
400 aa  335  9e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
400 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  46.19 
 
 
400 aa  335  9e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 
401 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  45.6 
 
 
400 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  42.46 
 
 
394 aa  332  6e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  45.95 
 
 
400 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  44.47 
 
 
400 aa  332  8e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 
395 aa  332  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 
395 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 
395 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 
395 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 
395 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 
395 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  45.71 
 
 
400 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
400 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  45.12 
 
 
407 aa  329  5.0000000000000004e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  41.16 
 
 
395 aa  328  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  42.49 
 
 
393 aa  328  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  44.75 
 
 
400 aa  328  9e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  45.41 
 
 
400 aa  328  9e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  41.16 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  45 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  40.51 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  44.02 
 
 
400 aa  327  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  41.98 
 
 
399 aa  323  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  40.25 
 
 
395 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  44.04 
 
 
400 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  43.3 
 
 
402 aa  323  3e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  44.53 
 
 
397 aa  322  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  41.01 
 
 
398 aa  323  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  43.43 
 
 
400 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  41.71 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  43.54 
 
 
388 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  42.97 
 
 
388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  44.02 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  41.71 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  43.54 
 
 
388 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>