More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2204 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 390 aa  800    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  76.92 
 
 		 390 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  69.92 
 
 		 390 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  64.18 
 
 		 393 aa  529  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  63.52 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  59.64 
 
 		 392 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  48.47 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  43.3 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.04 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  46.75 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  45.57 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  45.57 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  44.53 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  46.88 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  48.59 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  48.74 
 
 		 402 aa  359  5e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  47.19 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  44.27 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  43.78 
 
 		 388 aa  354  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  47.58 
 
 		 406 aa  352  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  46.41 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  43.8 
 
 		 399 aa  349  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  45.04 
 
 		 397 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  42.78 
 
 		 387 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  43.64 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  46.15 
 
 		 400 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  46.15 
 
 		 400 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  48.35 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  44.53 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  45.24 
 
 		 400 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  49.62 
 
 		 413 aa  342  7e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  44.95 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  48.01 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  46.19 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  46.06 
 
 		 411 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  44.13 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  47.34 
 
 		 460 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  45.01 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  40.92 
 
 		 399 aa  338  7e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  45.73 
 
 		 399 aa  338  9e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  44.47 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  44.76 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  44.25 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  45.27 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  42.11 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  44.08 
 
 		 407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  43.99 
 
 		 400 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  43.78 
 
 		 388 aa  336  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 389 aa  335  7e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  41.73 
 
 		 397 aa  335  7e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  44.78 
 
 		 405 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  44.22 
 
 		 393 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  42.24 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  42.24 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  42.24 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  42.24 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  42.24 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  42.24 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  46.56 
 
 		 402 aa  333  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  42.12 
 
 		 395 aa  333  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  43.54 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  45.19 
 
 		 393 aa  333  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  42.12 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  46.67 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  40.67 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  45.78 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  46.21 
 
 		 401 aa  333  4e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  45.8 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  43.67 
 
 		 401 aa  333  4e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  40.67 
 
 		 397 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  42.34 
 
 		 389 aa  332  6e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  44.5 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  42.34 
 
 		 395 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  44.76 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  45.34 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  44.42 
 
 		 393 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  45.89 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  44.19 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  44.25 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  44.7 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  40.46 
 
 		 395 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  44.44 
 
 		 400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  42.27 
 
 		 387 aa  329  6e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  44.5 
 
 		 400 aa  328  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  43.94 
 
 		 400 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  45.48 
 
 		 402 aa  328  8e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  41.49 
 
 		 389 aa  328  9e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  41.75 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  43.91 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  43.73 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  45.73 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  45.04 
 
 		 414 aa  327  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  41.6 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  44.58 
 
 		 409 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  47.07 
 
 		 415 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.149386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>