More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2987 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  100 
 
 
393 aa  813    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  65.64 
 
 
390 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  64.18 
 
 
390 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  64.18 
 
 
390 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  60.71 
 
 
392 aa  508  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  57.51 
 
 
397 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  47.31 
 
 
389 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  48.74 
 
 
398 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  45.64 
 
 
388 aa  360  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  43.59 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  45.27 
 
 
387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  45.45 
 
 
401 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  47.31 
 
 
392 aa  354  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 
395 aa  348  9e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  44.08 
 
 
397 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  44.33 
 
 
405 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  45.09 
 
 
397 aa  342  7e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  43.07 
 
 
397 aa  339  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  45.29 
 
 
406 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  42.71 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  42.71 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  42.49 
 
 
397 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  43.99 
 
 
388 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  43.99 
 
 
388 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 
398 aa  333  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  43.85 
 
 
388 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  45.11 
 
 
407 aa  331  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  45.12 
 
 
392 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  45.82 
 
 
402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  40.97 
 
 
397 aa  329  7e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  45.84 
 
 
413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  42.61 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  42.61 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  42.61 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  44.7 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  42.61 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  40.97 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  42.61 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 
399 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  42.36 
 
 
395 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  42.36 
 
 
395 aa  326  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  42.93 
 
 
393 aa  325  9e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  41.85 
 
 
395 aa  324  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  44.5 
 
 
392 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  41.85 
 
 
395 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  45.55 
 
 
415 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  41.03 
 
 
393 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  44.44 
 
 
460 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  42.11 
 
 
395 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  42.36 
 
 
399 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  44.84 
 
 
396 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 
395 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 
402 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  44.02 
 
 
414 aa  323  4e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  45.09 
 
 
401 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  43.07 
 
 
397 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  44.78 
 
 
401 aa  322  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  43.26 
 
 
410 aa  321  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  45.92 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  45.92 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  40.86 
 
 
395 aa  319  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  43.26 
 
 
400 aa  319  5e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  43.26 
 
 
402 aa  318  9e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  43.5 
 
 
400 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  45.15 
 
 
400 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  42.45 
 
 
397 aa  317  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  43.25 
 
 
400 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  44.42 
 
 
393 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  44.25 
 
 
400 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  43.25 
 
 
400 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  42.53 
 
 
392 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  43.88 
 
 
400 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  43 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  42.57 
 
 
411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  40.15 
 
 
397 aa  311  9e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  43.36 
 
 
400 aa  311  9e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  43.53 
 
 
400 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  42.5 
 
 
400 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  43.89 
 
 
404 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  46.31 
 
 
412 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  39.75 
 
 
399 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  41.58 
 
 
392 aa  311  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  40.82 
 
 
389 aa  311  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  41.41 
 
 
402 aa  311  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  43.39 
 
 
405 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  41.41 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  43 
 
 
415 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  42.82 
 
 
404 aa  309  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  42.75 
 
 
401 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  43.67 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  42.2 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  43.69 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  42.68 
 
 
409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  43.58 
 
 
415 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  42.42 
 
 
399 aa  306  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  43.88 
 
 
401 aa  306  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 
400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  43.26 
 
 
392 aa  305  7e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>