More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4358 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  83.17 
 
 
401 aa  658    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  81.5 
 
 
402 aa  656    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  100 
 
 
406 aa  819    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  85.18 
 
 
401 aa  663    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  80.74 
 
 
405 aa  676    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  76.26 
 
 
410 aa  618  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  76.63 
 
 
411 aa  617  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  78.03 
 
 
415 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  78.03 
 
 
400 aa  609  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  76.19 
 
 
415 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  73.45 
 
 
460 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  74.31 
 
 
411 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  74.13 
 
 
412 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  72.59 
 
 
402 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  70.32 
 
 
402 aa  568  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  73.16 
 
 
413 aa  562  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  69.46 
 
 
402 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  70.25 
 
 
405 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  72.29 
 
 
415 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  69 
 
 
409 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  61.35 
 
 
414 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  59.64 
 
 
401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  57.61 
 
 
412 aa  466  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  54.04 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  48.87 
 
 
398 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
395 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  45.06 
 
 
397 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  45.04 
 
 
397 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  45.2 
 
 
395 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  48.62 
 
 
401 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  44.95 
 
 
395 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  44.95 
 
 
395 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  46.06 
 
 
389 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  44.08 
 
 
395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  44.44 
 
 
395 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  48.5 
 
 
404 aa  360  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  46.33 
 
 
397 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.24 
 
 
397 aa  359  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  44.19 
 
 
395 aa  359  6e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  48.72 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  45.52 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  47.85 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  45.82 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  47.85 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  47.49 
 
 
400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  44.61 
 
 
402 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 
393 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  45.06 
 
 
396 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  47.58 
 
 
390 aa  352  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  41.62 
 
 
399 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  44.5 
 
 
399 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  46.84 
 
 
400 aa  351  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  46.43 
 
 
400 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  46.29 
 
 
400 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  44.78 
 
 
395 aa  348  8e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  41.56 
 
 
390 aa  348  8e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  40.25 
 
 
395 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  45.5 
 
 
392 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  42.03 
 
 
398 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  46.55 
 
 
400 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  44.97 
 
 
398 aa  346  5e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  44.02 
 
 
388 aa  345  6e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  46.58 
 
 
400 aa  345  8e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  46.31 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  47.07 
 
 
390 aa  343  4e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  45.76 
 
 
400 aa  342  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  44.33 
 
 
396 aa  339  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  44.92 
 
 
392 aa  339  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  44.9 
 
 
400 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  44.92 
 
 
400 aa  338  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  45.29 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  42.64 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  44.56 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  45.64 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  42.82 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  43.65 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  45.2 
 
 
400 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  42.78 
 
 
393 aa  335  7e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  44.25 
 
 
400 aa  334  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  43.99 
 
 
400 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  43 
 
 
402 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  45.98 
 
 
400 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  45.9 
 
 
393 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  44.86 
 
 
402 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  44.64 
 
 
400 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  44.53 
 
 
390 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  44.07 
 
 
397 aa  332  5e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  44.81 
 
 
401 aa  332  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  43.91 
 
 
400 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  45.8 
 
 
391 aa  331  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  44.61 
 
 
407 aa  332  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  44.92 
 
 
400 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  44.74 
 
 
378 aa  330  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  40.97 
 
 
399 aa  329  4e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  44.1 
 
 
400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>