More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1370 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  100 
 
 
378 aa  774    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  78.51 
 
 
402 aa  615  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  76.19 
 
 
402 aa  596  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  73.47 
 
 
399 aa  593  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  73.54 
 
 
402 aa  584  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  74.8 
 
 
402 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1189  aspartate aminotransferase, putative  75.93 
 
 
384 aa  570  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.415311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  48.93 
 
 
397 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  50.4 
 
 
402 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  49.2 
 
 
395 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  49.87 
 
 
397 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  52.96 
 
 
400 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  50.66 
 
 
400 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  47.31 
 
 
396 aa  372  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  50.53 
 
 
400 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
399 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  48.15 
 
 
396 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  50.81 
 
 
400 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  50.53 
 
 
400 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  51.2 
 
 
400 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  50.81 
 
 
400 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  50.4 
 
 
400 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
396 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  50.81 
 
 
400 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 
401 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  50.4 
 
 
400 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  50.8 
 
 
400 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  50.27 
 
 
400 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  48.94 
 
 
409 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  46.93 
 
 
395 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  48.82 
 
 
400 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  49.73 
 
 
400 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  47.99 
 
 
398 aa  362  8e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  50 
 
 
400 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  49.73 
 
 
400 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  49.74 
 
 
399 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  50 
 
 
400 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  50.27 
 
 
400 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  50 
 
 
400 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  49.47 
 
 
400 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  49.2 
 
 
400 aa  359  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  50.27 
 
 
400 aa  358  7e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  48.53 
 
 
399 aa  357  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  49.47 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  50 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  48.16 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  49.47 
 
 
401 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  49.47 
 
 
400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  355  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  47.76 
 
 
397 aa  355  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  46.7 
 
 
397 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  49.21 
 
 
398 aa  353  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  50.92 
 
 
397 aa  352  5e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  46.54 
 
 
390 aa  352  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  47.97 
 
 
399 aa  352  8e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  49.87 
 
 
400 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  48.9 
 
 
388 aa  349  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  46.97 
 
 
398 aa  350  3e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  47.61 
 
 
397 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  48.14 
 
 
400 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  46.97 
 
 
398 aa  349  4e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  48.55 
 
 
392 aa  349  5e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  48.81 
 
 
403 aa  347  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  47.61 
 
 
400 aa  347  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  46.72 
 
 
413 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  47.34 
 
 
400 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  48.02 
 
 
397 aa  346  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  43.35 
 
 
399 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  47.2 
 
 
395 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  48.41 
 
 
401 aa  347  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  46.97 
 
 
397 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  47.2 
 
 
395 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  46.83 
 
 
401 aa  346  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  47.09 
 
 
395 aa  345  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  45.91 
 
 
398 aa  344  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  47.24 
 
 
398 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  47.07 
 
 
400 aa  343  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  47.87 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  48.13 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  49.34 
 
 
393 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  46.67 
 
 
395 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  46.79 
 
 
387 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  46.67 
 
 
395 aa  342  5e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  47.87 
 
 
388 aa  342  5e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  45.91 
 
 
402 aa  342  5e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  47.75 
 
 
402 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  47.53 
 
 
396 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  46.56 
 
 
395 aa  341  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  46.56 
 
 
395 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  46.56 
 
 
395 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  46.56 
 
 
395 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  46.56 
 
 
395 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  47.75 
 
 
402 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  46.56 
 
 
395 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  45.79 
 
 
423 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  45.53 
 
 
394 aa  340  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  45.65 
 
 
410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  45.87 
 
 
404 aa  339  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>