More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1220 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  100 
 
 		 412 aa  845    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  74.81 
 
 		 401 aa  614  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  59.39 
 
 		 405 aa  485  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  59.69 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  60.26 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  57.61 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  56.78 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  56.83 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  57.87 
 
 		 401 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  55.86 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  57.32 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  57.11 
 
 		 402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  57.07 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  55.92 
 
 		 414 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  57.18 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  57.95 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  56.03 
 
 		 409 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  57.11 
 
 		 401 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  56.57 
 
 		 415 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  58.12 
 
 		 415 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  54.31 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  57.11 
 
 		 413 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  54.81 
 
 		 412 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  54.02 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  48.35 
 
 		 392 aa  358  7e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  47.49 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  45.96 
 
 		 389 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  44.81 
 
 		 397 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  43.8 
 
 		 397 aa  348  9e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  43.29 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  42.17 
 
 		 399 aa  345  6e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  47.19 
 
 		 400 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  47.12 
 
 		 400 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  43.72 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  47.34 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  46.12 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  46.12 
 
 		 400 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  43.07 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  43.65 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  45.18 
 
 		 397 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  42.68 
 
 		 395 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  42.68 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  42.93 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  42.93 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  42.93 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  42.93 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  42.93 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  44.05 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  44.67 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 		 395 aa  329  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  41.77 
 
 		 395 aa  326  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  44.19 
 
 		 393 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  41.92 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  42.17 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  42.75 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  42.17 
 
 		 390 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  42.28 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  42.39 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  43.29 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  44.13 
 
 		 390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  43.69 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  44.64 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  43 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  41.81 
 
 		 402 aa  319  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  41.43 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  43.11 
 
 		 398 aa  319  7e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  43.4 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  46.04 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  43.18 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  41.67 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 		 387 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  42.28 
 
 		 406 aa  315  7e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  39.75 
 
 		 395 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  39.9 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  41.41 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  41.96 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  41.37 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  41.84 
 
 		 390 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  40.15 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  42.24 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  42.42 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  42.24 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  42.13 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  42.2 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  38.13 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  42.42 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  41.41 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  42.28 
 
 		 400 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  38.13 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  43.91 
 
 		 404 aa  308  9e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  39.95 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  43.72 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  41.92 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  41.62 
 
 		 401 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 		 400 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  41.88 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  40.66 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>