More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5107 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  100 
 
 
405 aa  815    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  85.82 
 
 
402 aa  689    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  80.74 
 
 
406 aa  676    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  82.96 
 
 
401 aa  646    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  81.45 
 
 
401 aa  654    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  80.35 
 
 
415 aa  617  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  76.57 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  76.07 
 
 
415 aa  594  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  73.3 
 
 
410 aa  594  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  72.36 
 
 
460 aa  581  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  71.43 
 
 
411 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  72.32 
 
 
402 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  72.11 
 
 
411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  71.32 
 
 
402 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  70.82 
 
 
405 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  72.18 
 
 
415 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  71.11 
 
 
413 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  71.25 
 
 
412 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  69.08 
 
 
409 aa  551  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  69.62 
 
 
402 aa  548  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  60.1 
 
 
414 aa  508  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  59.39 
 
 
412 aa  485  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  58.79 
 
 
401 aa  477  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  55.42 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  48.99 
 
 
398 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
395 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  48.74 
 
 
400 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  48.48 
 
 
400 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  45.8 
 
 
395 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  45.8 
 
 
395 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  45.8 
 
 
395 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  45.8 
 
 
395 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  48.74 
 
 
400 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  45.8 
 
 
395 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  45.8 
 
 
395 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  48.74 
 
 
400 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  45.34 
 
 
397 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 
395 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 
395 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  44.53 
 
 
395 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.34 
 
 
397 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  45.32 
 
 
397 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  46.53 
 
 
389 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  47.21 
 
 
402 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  46.33 
 
 
396 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  47.36 
 
 
397 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
395 aa  359  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  44.53 
 
 
395 aa  358  8e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  45.36 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  47.15 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  47.18 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  43.32 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  47.33 
 
 
401 aa  356  5e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  45.11 
 
 
400 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  45.61 
 
 
400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  45.25 
 
 
399 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  46.97 
 
 
400 aa  351  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  45.11 
 
 
400 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  45.36 
 
 
400 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  45.55 
 
 
393 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  45.15 
 
 
396 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  45.06 
 
 
396 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  46.73 
 
 
400 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  45.11 
 
 
400 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 
400 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  44.33 
 
 
393 aa  343  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  43.29 
 
 
398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  40.66 
 
 
399 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  45.57 
 
 
402 aa  342  5e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  45.8 
 
 
402 aa  342  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  43.61 
 
 
400 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  43.36 
 
 
400 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  43.86 
 
 
400 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  44.27 
 
 
390 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  45.36 
 
 
407 aa  340  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  45.11 
 
 
400 aa  341  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  44.11 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  46.15 
 
 
402 aa  340  4e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  44.92 
 
 
392 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  46.33 
 
 
400 aa  339  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  44.27 
 
 
388 aa  338  9e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  41.22 
 
 
390 aa  338  9e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  43.58 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  43.72 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  44.11 
 
 
401 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  45.29 
 
 
390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  43.64 
 
 
400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  44.81 
 
 
400 aa  336  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  43.11 
 
 
394 aa  336  5e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  43.51 
 
 
393 aa  335  5.999999999999999e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  44.78 
 
 
390 aa  335  9e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  42.39 
 
 
387 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  42.49 
 
 
395 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 
392 aa  334  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  43.36 
 
 
400 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  44.5 
 
 
402 aa  334  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  43.94 
 
 
398 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  47.12 
 
 
397 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  46.36 
 
 
378 aa  332  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  44.64 
 
 
393 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>