More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1440 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  100 
 
 
399 aa  826    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  83.97 
 
 
402 aa  680    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  81.91 
 
 
402 aa  668    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  81.41 
 
 
402 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  76.46 
 
 
402 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1189  aspartate aminotransferase, putative  79.37 
 
 
384 aa  595  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.415311 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  73.47 
 
 
378 aa  585  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  51.92 
 
 
400 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
397 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  51.66 
 
 
400 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  47.97 
 
 
396 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 
395 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  52.63 
 
 
398 aa  388  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  48.98 
 
 
397 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  51.27 
 
 
394 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  48.72 
 
 
396 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  50.78 
 
 
400 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  51.16 
 
 
401 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
399 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  50.51 
 
 
395 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 
394 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  49.62 
 
 
397 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  48.21 
 
 
402 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  49.62 
 
 
399 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  49.23 
 
 
399 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
400 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
400 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  49.48 
 
 
396 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  49.87 
 
 
398 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  49.36 
 
 
397 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  47.57 
 
 
401 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  48 
 
 
399 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 
400 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 
400 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  46.94 
 
 
405 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  48.21 
 
 
397 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  48.98 
 
 
400 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  47.12 
 
 
404 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  48.72 
 
 
400 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  48.06 
 
 
409 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  49.74 
 
 
401 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  48.72 
 
 
400 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 
400 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  48.72 
 
 
400 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  45.62 
 
 
395 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  48.98 
 
 
400 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  47.45 
 
 
398 aa  367  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 
400 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  48.08 
 
 
392 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  47.7 
 
 
400 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 
400 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  49.49 
 
 
402 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  48.21 
 
 
400 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  47.96 
 
 
400 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  49.49 
 
 
402 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  48.85 
 
 
387 aa  363  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 
400 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  49.74 
 
 
400 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  50.64 
 
 
393 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  47.81 
 
 
398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  48.21 
 
 
400 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  48.7 
 
 
401 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  48.34 
 
 
400 aa  362  8e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  45.55 
 
 
397 aa  362  8e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  47.96 
 
 
400 aa  362  9e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  47.46 
 
 
392 aa  361  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  46.92 
 
 
402 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  46.33 
 
 
396 aa  360  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  47.01 
 
 
404 aa  359  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  47.96 
 
 
393 aa  359  5e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  47.56 
 
 
388 aa  358  9e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  47.31 
 
 
400 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  47.45 
 
 
400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  48.48 
 
 
404 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  47.04 
 
 
409 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  46.91 
 
 
395 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  45.92 
 
 
400 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  45.66 
 
 
400 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  46.65 
 
 
395 aa  354  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  46.65 
 
 
395 aa  354  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  46.27 
 
 
390 aa  355  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  46.65 
 
 
395 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  46.27 
 
 
410 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  47.19 
 
 
400 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  45.66 
 
 
400 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  45.5 
 
 
398 aa  353  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  47.44 
 
 
396 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  48.33 
 
 
388 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  46.4 
 
 
452 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  47.8 
 
 
388 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  46.92 
 
 
389 aa  352  5e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  47.8 
 
 
388 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  47.14 
 
 
400 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  46.39 
 
 
395 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  46.39 
 
 
395 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  46.39 
 
 
395 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  46.39 
 
 
395 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>